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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 分子模拟中刚柔性和亲水性怎么表示 已有2人参与

如题,在聚合物链中,由于主链上是否还带其它基团(如甲基)对宏观性能影响很大,现在只能猜测是这两个因素,
一个是链的刚柔性不一样,另一个是链的亲水性不一样,想通过分子模拟来求证,可是要怎么表征呢?
请大侠指点,金币好说
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ktwyw

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
赵红霞: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2014-12-26 14:27:44
关于在分子模拟里表征高分子链的柔顺性,你可考虑去计算
(1)二面角内旋转位能曲线,这一点fanc232已经提到了,表征链的静态柔顺性的重要参数是旁式与反式的势能位垒,位垒越低,链越柔顺;
(2)计算链的末端距与聚合度的关系,然后构建高斯等效链段模型,由此可以得到Flory特征比或者Kuhn链段长度,这两个值越小,链越柔顺;
(3)计算键取向的相关函数(correlation function of bond orientation), 相关函数衰减的越快,链越柔顺。根据相关函数的衰减你可以可以得到链的持久长度,持久长度越小,链越柔顺。

关于在分子模拟里表征链的水溶性,你可以考虑去计算聚合物和水各自的Hildebrand溶度参数(solubility parameter)(注:其实这些对于常见高分子,你查表也可以查得到),然后得到Flory-Huggin Chi-parameter,  chi值越小,说明聚合物的水溶性与好。

聚合物和蛋白还是不太一样,我个人觉得fanc232提出的方案可能行不通。

另外,就你给的两个分子,看上去柔顺性和水溶性应该都是PAA要比PCA好一点吧,你想通过分子模拟证实这一点么?
好好学习,天天向上。
10楼2014-12-26 14:03:37
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

补充一点,这个聚合物本身就具有一定的水溶性,我看论坛里都说用接触角仪测接触角,对于水溶性的聚合物也适用吗?
2楼2014-12-25 18:25:53
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ktwyw

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
没看懂你具体的问题。高分子物理里表征链的静态柔顺性的参数是持久长度,水溶性你可以去查聚合物与水的Flory-huggins参数,这些物理量实验上都可以测,分子模拟里面原则上也可以算,这样算回答你的问题么?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
好好学习,天天向上。
3楼2014-12-25 18:46:12
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

打个比方,如下图,左边和右边聚合物的区别在于右边的主链上挂了一个甲基,那么我现在想比较两者的分子刚柔性和亲水性,请问如何通过分子模拟来表征呢?
分子模拟中刚柔性和亲水性怎么表示
1.png

4楼2014-12-25 19:00:17
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