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lybio

金虫 (正式写手)

[交流] 连接体系中啥出问题了?

10ul连接体系:
载体   2.7ul(约50ng)先平端酶切,胶回收。后CIAP,用酚抽提,醇沉淀。
                                用灭菌,经55度预热的ddW溶解。
DNA片断    2.7ul(约100ng) 用pfu酶进行PCR(PCR产物是平端的),
                                          胶回收。与载体摩尔比约10:1

PEG8000    3.7ul(终浓度为15%)
T4连接酶 buffer   1ul
T4连接酶(宝生物)   1ul
16度反应16h,也试过用16度,22度,4度的不同温度循环反应。但就一直没连上,转化的大肠杆菌一个都没长,到底是哪出了问题?谢谢指教!

[ Last edited by lybio on 2008-5-22 at 19:47 ]
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humants

金虫 (正式写手)

建议取保生物的论坛上问一下,他们自己的东西因该比较了解。
2楼2008-05-21 16:22:16
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sailor7166262

金虫 (小有名气)

平锻端连接的连接酶的用量要大于粘端连接,你的酶量太少啦,建议扩大连接体系,增加连接酶量。而且你的载体都是平端酶切是用的同样的酶吗?单切还是双切?建议作一个对照,看看是否需要去磷酸化,载体自连效率如何。

其次,检查一下你的感受态。
3楼2008-05-21 17:43:53
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yangym1123

木虫 (小有名气)

感受态细胞没有问题吧?
4楼2008-05-21 20:50:41
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weiwei1

木虫 (小有名气)

回收后,载体和片段测浓度了吗,还是按照之前的浓度计算的?回收后还有多少量?而且乙醇沉淀也可能把片段弄丢
5楼2008-05-22 08:29:44
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jerome711

银虫 (小有名气)

我从你的体系里没有看见连接酶啊????
DNA Ligase
做懂得生活的人
6楼2008-05-22 09:37:33
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cdl007

木虫 (正式写手)

载体   2.7ul(约50ng)
DNA片断    2.7ul 约100ng
明显比例不对,2:1
还有你总体系太小了,怎么才10ul
扩大体系,因为这是一个概率问题,你东西多了,总有能连上的,
还有你涂板的时候多少菌液涂一个板?一般是100ul-200ul,建议你500ul涂,或者将将菌液多涂几个板,别浪费了
多做两次吧,毕竟是小概率事件,酶连温度16可以了,别的是考虑酶连出错才摸索的,你跟本没出来的话,摸那个温度没意义。
7楼2008-05-22 12:16:50
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redsnowing575

银虫 (小有名气)

连接前还是要跑个电泳看看载体和外源的浓度再连接,一般载体要20-30ng/ul 就可以了,连接的时候只要1ul 就够了,外源多加一些,我们这里不加PEG做平端连接连得也挺好的,另外检查你的感受态是不是有问题。
8楼2008-05-22 17:05:18
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playboy723

金虫 (正式写手)

呵呵  我知道原因  但你得给我加金币
1:你的引物5,端加P了没?  你把载体去P了    假如引物5,端没有P话根本不可能连上的
2:平端连的时候体系中要加些ATP,这样效率高些   另外比例也一定要控制好,严格按照1:3-10   否则也很难连的
你试试吧
9楼2008-05-22 20:59:07
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lybio

金虫 (正式写手)

引物5‘端为什么要加P呢?只要载体去P,DNA片段跟它也能连接上,只是有一个缺口而已,最后还是能补平的,不是吗?
10楼2008-05-22 21:18:52
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