24小时热门版块排行榜    

查看: 1357  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

wangyulinup

金虫 (正式写手)

[求助] DL_POLY计算error-65,恳请大师出手相助,拜上!! 已有1人参与

本人,小硕一枚,模拟初手,用DL_POLY做MD。原先用实验室单机使用DL_POLY4.03 做MD计算,但实在是太慢。最近最老师在尝试在机群上安装了DL_POLY4.04,让我尝试做MD 计算,我倍感高兴,计算速度提高了很多倍。。但有些作业能正常计算算得相当快很给力,但问题是,也有些作业提交后都没开始计算立马会出现error-65 ,如图1。
       关于error-65,我找到了DL_POLY4.03与DL_POLY 2两个版本的手册,相应的解释分别如下截图(图2,图3)。根据手册,多次尝试想修改子程序,但本人程序功底实在太差,因此,只能裹足不前,眼睁睁的看着伟大的机群,却只能在单机上耗。。。现发此贴恳请大师出手相助,晚辈将感激不尽!

DL_POLY计算error-65,恳请大师出手相助,拜上!!
图1.jpg


DL_POLY计算error-65,恳请大师出手相助,拜上!!-1
图2.jpg


DL_POLY计算error-65,恳请大师出手相助,拜上!!-2
图3.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyulinup

金虫 (正式写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by 老虎大王 at 2014-12-14 10:30:22
你可在此基础上调整Constraint。 其中你的Constraint好像包括阳离子,这一点尤其可疑。一般约束应该是在CO3离子之内。...

大王,我知道了,非常感谢您出手相助!

[ 发自小木虫客户端 ]
12楼2014-12-14 11:33:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

oxox6085

专家顾问 (正式写手)

单机可以机群不可以?感觉你是输入文件搞错了吧?
有些事情可能只有计算机模拟能告诉我们答案
2楼2014-12-04 23:52:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyulinup

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by oxox6085 at 2014-12-04 23:52:06
单机可以机群不可以?感觉你是输入文件搞错了吧?

大师,是的,单机上能正常计算的作业,机群上一开始计算OUTPUT就显示error-65。输入文件,我用的是单机上能正确计算的输入文件,我想应该没搞错的。我想可能是不是机群计算对于体系的要求高,或者别的原因。
3楼2014-12-05 09:55:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老虎大王

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

你再试试,要保证单机和集群上用的完全相同的输入文件。或者你在集群上用串行方式运行,看看和并行方式运行结果有什么不同。
4楼2014-12-08 21:50:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +6 雨打竹帘 2026-08-30 10/500 2026-08-31 09:29 by huixian257
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 能否申诉? +6 echo8914667 2026-08-30 7/350 2026-08-31 08:41 by kingkocxr
[基金申请] 面上意见出来了 +10 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 19/950 2026-08-31 08:01 by blueearth171
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +6 gdd2018 2026-08-28 11/550 2026-08-30 08:58 by 超级无敌华子
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
请填处理意见