24小时热门版块排行榜    

查看: 1312  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

wangyulinup

金虫 (正式写手)

[求助] DL_POLY计算error-65,恳请大师出手相助,拜上!! 已有1人参与

本人,小硕一枚,模拟初手,用DL_POLY做MD。原先用实验室单机使用DL_POLY4.03 做MD计算,但实在是太慢。最近最老师在尝试在机群上安装了DL_POLY4.04,让我尝试做MD 计算,我倍感高兴,计算速度提高了很多倍。。但有些作业能正常计算算得相当快很给力,但问题是,也有些作业提交后都没开始计算立马会出现error-65 ,如图1。
       关于error-65,我找到了DL_POLY4.03与DL_POLY 2两个版本的手册,相应的解释分别如下截图(图2,图3)。根据手册,多次尝试想修改子程序,但本人程序功底实在太差,因此,只能裹足不前,眼睁睁的看着伟大的机群,却只能在单机上耗。。。现发此贴恳请大师出手相助,晚辈将感激不尽!

DL_POLY计算error-65,恳请大师出手相助,拜上!!
图1.jpg


DL_POLY计算error-65,恳请大师出手相助,拜上!!-1
图2.jpg


DL_POLY计算error-65,恳请大师出手相助,拜上!!-2
图3.jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyulinup

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by oxox6085 at 2014-12-04 23:52:06
单机可以机群不可以?感觉你是输入文件搞错了吧?

大师,是的,单机上能正常计算的作业,机群上一开始计算OUTPUT就显示error-65。输入文件,我用的是单机上能正确计算的输入文件,我想应该没搞错的。我想可能是不是机群计算对于体系的要求高,或者别的原因。
3楼2014-12-05 09:55:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

oxox6085

专家顾问 (正式写手)

单机可以机群不可以?感觉你是输入文件搞错了吧?
有些事情可能只有计算机模拟能告诉我们答案
2楼2014-12-04 23:52:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老虎大王

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

你再试试,要保证单机和集群上用的完全相同的输入文件。或者你在集群上用串行方式运行,看看和并行方式运行结果有什么不同。
4楼2014-12-08 21:50:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyulinup

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 老虎大王 at 2014-12-08 21:50:15
你再试试,要保证单机和集群上用的完全相同的输入文件。或者你在集群上用串行方式运行,看看和并行方式运行结果有什么不同。

大王,输入文件保证全同。晚辈追问两个问题,1,对于error—65,,大王你有何建议??2..具体来讲,CaCl2、LiCl体系可以成功计算,其余CaCO3、MgSO4及氨基酸的水体系则提交作业后立马出现error—65。大师,能否根据此线索找到具体原因。我有些怀疑是势函数所致!

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2014-12-09 00:19:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 11/550 2026-08-13 10:40 by ZH远山
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +9 家与远方 2026-08-10 14/700 2026-08-13 09:41 by 臭臭不臭01
[基金申请] filecode +13 documentary 2026-08-10 15/750 2026-08-12 15:56 by 云上清扬
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +3 majunge000 2026-08-11 4/200 2026-08-11 20:13 by lch2012
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
信息提示
请填处理意见