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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 拟南芥Genotyping T-DNA LB引物问题
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银虫 (初入文坛)

[求助] 拟南芥Genotyping T-DNA LB引物问题

>LB1 for SAIL lines C/418-451 of pCSA110-pDAP101_T-DNAs
GCCTTTTCAGAAATGGATAAATAGCCTTGCTTCC
>LB2 for SAIL lines C/390-423 of pCSA110-pDAP101_T-DNAs
GCTTCCTATTATATCTTCCCAAATTACCAATACA
>LB3 for SAIL lines C/350-383 of pCSA110-pDAP101_T-DNAs
TAGCATCTGAATTTCATAACCAATCTCGATACAC

如题，这是拟南芥LB引物的信息
其中的418-451，390-423，350-383等应该是该段序列在T-DNA上的位置。正常来说应该是5'-3'方向的。
但T-DNA是双链，那么这个方向是针对哪一条链来说的呢？

P.S：根据定义，与mRNA方向相同的DNA链称为有义链，那么有义链是针对转录而言的。若T-DNA上有多个基因，如果它们的模板链都在一条链上，则可定义另一条链为正链。那么，它们的模板链是相同的吗？如果不全相同，则DNA的有义链是如何定义的呢？
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1楼 2014-11-24 16:29:40
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