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molx79

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何用multiwfn来求密度差(某个体系的密度减去组成它的各个片段的密度)的极值。 已有1人参与

我尝试的例子是水二聚体和两个单体水的密度差。(复合物(H2O)2.wfn;单体H2O-1.wfn和H2O-2.wfn)
想计算里面的某个原子周围密度差的极值(文献上叫most negative density difference values(e per bohr3))
求详细做法。以及默认的密度差的单位。
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  • 2014-11-14 13:19:07, 21.33 K

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molx79

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2014-11-15 11:21:09
用multiwfn来求密度差,详见:《使用Multiwfn作电子密度差图》  http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3980314
默认的密度差的单位就是:(e per bohr^3)。

most negative(最负值)这样的单点値,应该没有什 ...

非常感谢
3楼2014-11-17 08:01:44
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3, 感谢应助 2014-11-16 05:52:15
molx79: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-11-17 08:01:26
用multiwfn来求密度差,详见:《使用Multiwfn作电子密度差图》  http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3980314
默认的密度差的单位就是:(e per bohr^3)。

most negative(最负值)这样的单点値,应该没有什么实际意义。因此将你的问题转问sobereva博士,她说:
“我不觉得最负的值有什么物理意义,毕竟那只是一个点的数值,说明不了什么问题。
想得到的话,先用主功能5照常做密度差以得到密度差格点数据,算完之后屏幕上就有这样的提示
The minimum is -0.93736224D+00 at  -0.02387   0.03594   0.23631 (Bohr)
说明了整个空间中最负的值和那个点的位置。
但是他说“原子周围”,这就比较含糊,因为没有唯一的方法去划分原子。如果用AIM方法定义原子的空间,从中找最负的值,Multiwfn倒是也能做,不过需要利用一些技巧才能实现(要用到盆分析)。”

对于在空间分布的正値或负値区域,它们可能就分布在某个“原子周围”,这时可以通过Multiwfn作盆分析,求得某个“原子周围”正或负值的具体电子(电荷)数量,它是这个“原子周围”增加或减少的电子(电荷)数量。
2楼2014-11-15 11:21:09
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