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youyno

银虫 (正式写手)

[求助] Multiwfn在AIM分析中的准确性如何? 已有1人参与

实验室课题组的经费有限,只买了高斯09,而高斯09针对于含有赝势的重原子的AIM处理却是个BUG,而且高斯本身做AIM分析就不被推荐,因此我一直在寻找能够做AIM的免费软件,一开始用了AIMALL的试用版,但是其所含的波函数难以满足计算精度要求,在纠结中发现Multwfn这一款国人开发的免费软件不仅功能强大而且Sob姐的后续支持也十分给力。但是我现在纠结的是几乎没有看到有文献用Multiwfn做AIM分析的,所以对于他的准确度相对于专业的AIM2000、AIMPAC、AIMALL等程序是否可靠的问题,希望得到大家的详解!希望Sob姐不要介意啊!
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WANG7303

木虫 (著名写手)

同求 最近也在用这个
2楼2014-04-04 15:30:30
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

据我测试,Multiwfn、AIMALL、AIMPAC做AIM分析的结果是完全相同的。ECP+WFX的情况下,前两个程序的结果也是相同的。
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2014-04-04 20:07:26
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huangry2006

木虫 (正式写手)

经测试,数值可信。
4楼2014-04-04 20:09:22
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
youyno: 金币+8, ★★★很有帮助 2014-04-05 01:42:47
zhou2009: 金币+8 2014-04-05 05:29:34
Multiwfn 3.0刚开始推出的时候用的是纯粹的立方格点来积分盆,那时候虽然积分ELF等函数的盆没问题,但是积分AIM盆精度不好。后来经过不懈的改进,我提出了一种原子中心积分结合立方格点的混合积分方法,并且引入了边界修正步骤,这样一来,在中等质量格点下AIM盆积分精度就对一般的应用就已经足够精确了,见手册4.17.1节的示例和讨论。注意不要用Multiwfn的老版本,尽量用最新版本。
因为这个功能在Multiwfn里引入的时间并不长,而且也有AIMALL等成熟的程序,所以文献中见到Multiwfn做AIM盆积分的不多(用Multiwfn做ELF盆积分的倒是已经有很多篇了,包括JCTC、JCC上的文章),但应用实例也是有的。前不久发表了篇文章,通过Multiwfn的盆积分功能研究了AIM盆里的信息熵的分布,得到了很精确,很好的结果,参见Dissecting molecular descriptors into atomic contributions in density functional reactivity theory (JCP, 140, 024109)
5楼2014-04-04 20:21:07
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youyno

银虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by sobereva at 2014-04-04 20:21:07
Multiwfn 3.0刚开始推出的时候用的是纯粹的立方格点来积分盆,那时候虽然积分ELF等函数的盆没问题,但是积分AIM盆精度不好。后来经过不懈的改进,我提出了一种原子中心积分结合立方格点的混合积分方法,并且引入了边 ...

等的就是Sob姐的回答

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平生多磨砺,男儿自横行!
6楼2014-04-05 01:44:58
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
youyno: 金币+7, ★★★★★最佳答案 2014-04-05 06:26:39
我之前只说了AIM分析的盆分析部分,再说一下AIM拓扑分析。

Multiwfn的主功能2做AIM拓扑分析极为方便、灵活、强大,精度绝对准确(其实拓扑分析远比盆积分容易实现,算法比较标准,因此各种程序的结果都能很好地对应)。拓扑分析速度比AIMALL更快,临界点、键径的可视化比起AIMALL方便得多。速度比AIM2000更是快一个数量级以上。而且灵活程度远胜于AIMALL、AIM2000,比如可以十分方便地修改临界点、键径的信息、导入导出,还能计算比如沿着拓扑路径上各种实空间函数的变化等等,这都是其它AIM程序都不具备的。在AIM拓扑分析方面,Multiwfn是绝对的最佳选择,没有之一。
至于AIMPAC已经太老了,各方面都不好用,已经不用提了。

用Multiwfn做AIM拓扑分析的文章已经很多了,得有几十篇了。连Nature Chemistry上的一篇文章都用的是Multiwfn而非其它程序做的AIM分析(见DOI: 10.1038/NCHEM.1776),挺有名的一本书Essentials of Computational Chemistry-Theories and Models的作者C. J. Cramer的课题组的文章也用了Multiwfn做拓扑分析。Multiwfn毕竟诞生较晚,介绍文章前年2月才刊登,很多人还不知道其拓扑分析功能的强大,我相信凡是用熟了Multiwfn做拓扑分析的人就不会再打算用AIMALL和AIM2000了。
7楼2014-04-05 04:16:46
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youyno

银虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by sobereva at 2014-04-05 04:16:46
我之前只说了AIM分析的盆分析部分,再说一下AIM拓扑分析。

Multiwfn的主功能2做AIM拓扑分析极为方便、灵活、强大,精度绝对准确(其实拓扑分析远比盆积分容易实现,算法比较标准,因此各种程序的结果都能很好地对 ...

我一般用到的也就是拓扑分析成键类型和相互作用,至于AIM的盆分析听说过也用Mulitwfn做过,但是得到的信息看起来完全没有头绪。

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8楼2014-04-05 06:55:21
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