应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Multiwfn » Multiwfn在AIM分析中的准确性如何？
81/1返回列表
查看: 1853  |  回复: 7
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

youyno

银虫 (正式写手)

[求助] Multiwfn在AIM分析中的准确性如何？已有1人参与

实验室课题组的经费有限，只买了高斯09，而高斯09针对于含有赝势的重原子的AIM处理却是个BUG，而且高斯本身做AIM分析就不被推荐，因此我一直在寻找能够做AIM的免费软件，一开始用了AIMALL的试用版，但是其所含的波函数难以满足计算精度要求，在纠结中发现Multwfn这一款国人开发的免费软件不仅功能强大而且Sob姐的后续支持也十分给力。但是我现在纠结的是几乎没有看到有文献用Multiwfn做AIM分析的，所以对于他的准确度相对于专业的AIM2000、AIMPAC、AIMALL等程序是否可靠的问题，希望得到大家的详解！希望Sob姐不要介意啊！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
平生多磨砺，男儿自横行！
1楼2014-04-04 15:03:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

WANG7303

木虫 (著名写手)
同求 最近也在用这个
赞一下 回复此楼
2楼2014-04-04 15:30:30
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
据我测试，Multiwfn、AIMALL、AIMPAC做AIM分析的结果是完全相同的。ECP+WFX的情况下，前两个程序的结果也是相同的。
赞一下(1人) 回复此楼
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2014-04-04 20:07:26
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huangry2006

木虫 (正式写手)
经测试，数值可信。
回复此楼
4楼2014-04-04 20:09:22
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
youyno: 金币+8, ★★★很有帮助 2014-04-05 01:42:47
zhou2009: 金币+8 2014-04-05 05:29:34
Multiwfn 3.0刚开始推出的时候用的是纯粹的立方格点来积分盆，那时候虽然积分ELF等函数的盆没问题，但是积分AIM盆精度不好。后来经过不懈的改进，我提出了一种原子中心积分结合立方格点的混合积分方法，并且引入了边界修正步骤，这样一来，在中等质量格点下AIM盆积分精度就对一般的应用就已经足够精确了，见手册4.17.1节的示例和讨论。注意不要用Multiwfn的老版本，尽量用最新版本。
因为这个功能在Multiwfn里引入的时间并不长，而且也有AIMALL等成熟的程序，所以文献中见到Multiwfn做AIM盆积分的不多（用Multiwfn做ELF盆积分的倒是已经有很多篇了，包括JCTC、JCC上的文章），但应用实例也是有的。前不久发表了篇文章，通过Multiwfn的盆积分功能研究了AIM盆里的信息熵的分布，得到了很精确，很好的结果，参见Dissecting molecular descriptors into atomic contributions in density functional reactivity theory (JCP, 140, 024109)
赞一下 回复此楼
5楼2014-04-04 20:21:07
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youyno

银虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by sobereva at 2014-04-04 20:21:07
Multiwfn 3.0刚开始推出的时候用的是纯粹的立方格点来积分盆，那时候虽然积分ELF等函数的盆没问题，但是积分AIM盆精度不好。后来经过不懈的改进，我提出了一种原子中心积分结合立方格点的混合积分方法，并且引入了边 ...

等的就是Sob姐的回答

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
平生多磨砺，男儿自横行！
6楼2014-04-05 01:44:58
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
youyno: 金币+7, ★★★★★最佳答案 2014-04-05 06:26:39
我之前只说了AIM分析的盆分析部分，再说一下AIM拓扑分析。

Multiwfn的主功能2做AIM拓扑分析极为方便、灵活、强大，精度绝对准确（其实拓扑分析远比盆积分容易实现，算法比较标准，因此各种程序的结果都能很好地对应）。拓扑分析速度比AIMALL更快，临界点、键径的可视化比起AIMALL方便得多。速度比AIM2000更是快一个数量级以上。而且灵活程度远胜于AIMALL、AIM2000，比如可以十分方便地修改临界点、键径的信息、导入导出，还能计算比如沿着拓扑路径上各种实空间函数的变化等等，这都是其它AIM程序都不具备的。在AIM拓扑分析方面，Multiwfn是绝对的最佳选择，没有之一。
至于AIMPAC已经太老了，各方面都不好用，已经不用提了。

用Multiwfn做AIM拓扑分析的文章已经很多了，得有几十篇了。连Nature Chemistry上的一篇文章都用的是Multiwfn而非其它程序做的AIM分析（见DOI: 10.1038/NCHEM.1776），挺有名的一本书Essentials of Computational Chemistry-Theories and Models的作者C. J. Cramer的课题组的文章也用了Multiwfn做拓扑分析。Multiwfn毕竟诞生较晚，介绍文章前年2月才刊登，很多人还不知道其拓扑分析功能的强大，我相信凡是用熟了Multiwfn做拓扑分析的人就不会再打算用AIMALL和AIM2000了。
赞一下 回复此楼
7楼2014-04-05 04:16:46
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youyno

银虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by sobereva at 2014-04-05 04:16:46
我之前只说了AIM分析的盆分析部分，再说一下AIM拓扑分析。

Multiwfn的主功能2做AIM拓扑分析极为方便、灵活、强大，精度绝对准确（其实拓扑分析远比盆积分容易实现，算法比较标准，因此各种程序的结果都能很好地对 ...

我一般用到的也就是拓扑分析成键类型和相互作用，至于AIM的盆分析听说过也用Mulitwfn做过，但是得到的信息看起来完全没有头绪。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
平生多磨砺，男儿自横行！
8楼2014-04-05 06:55:21
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 youyno 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭