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Miracle922

铜虫 (正式写手)

[求助] 如何用Multiwfn软件做出P DOS?

用Multiwfn可以很容易做出Total DOS,但是我想看P或者d轨道对DOS的贡献,是否需要用高斯重新计算生成文件,转化成fch?如果做输入文件呢,非常感谢。另外,DOS横坐标的能量是一个什么含义呢?

无标题.jpg
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做到极致,做到细处
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2012-09-14 22:57:10
Miracle922: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2012-09-15 08:12:31
横坐标就是能量。分子体系分子轨道能级是离散的,分子轨道能量是多少,在哪个横坐标位置TDOS上就表示为一个竖条(代表在这里有个能量态),而展宽后,就是一个峰形。

你要做的图是PDOS。由于Multiwfn需要计算出p、d轨道对分子轨道的贡献才能做这样的图,而Multiwfn的轨道成分分析又需要fch文件,所以必须以fch文件作为输入。
作图过程可以看手册4.10节的例子。与做TDOS的区别就是在选择作图之前,先选-1进入设定片段的界面,把对应于你要考察的p或d轨道相应的基函数都加进片段里,然后作图时就会同时出现PDOS。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2012-09-14 18:47:03
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Miracle922

铜虫 (正式写手)

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2楼: Originally posted by sobereva at 2012-09-14 18:47:03
横坐标就是能量。分子体系分子轨道能级是离散的,分子轨道能量是多少,在哪个横坐标位置TDOS上就表示为一个竖条(代表在这里有个能量态),而展宽后,就是一个峰形。

你要做的图是PDOS。由于Multiwfn需要计算出p ...

谢谢回复,先前只关注了3-12。现在已经能通过软件得到pDOS图。还有一个问题就是,横轴对应的费米能级如何选取?论坛里有各种简介,也消除了我的一个误解就是将0的位置认为费米能级。我的体系是小分子团簇体系,那么它的费米能级与HOMO是否有等同关系?附件中的Figure 5中标示了费米能级的位置,我不确定类似体系的费米能级的确定方法,不知道Sobereva是否有更好的建议。
做到极致,做到细处
3楼2012-09-15 09:27:08
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2楼: Originally posted by sobereva at 2012-09-14 18:47:03
横坐标就是能量。分子体系分子轨道能级是离散的,分子轨道能量是多少,在哪个横坐标位置TDOS上就表示为一个竖条(代表在这里有个能量态),而展宽后,就是一个峰形。

你要做的图是PDOS。由于Multiwfn需要计算出p ...

不好意思,这个回复附件好像没法上传 我就通过猪八戒上传 地址:http://g.zhubajie.com/urllink.php?id=12796239e5f2f90t1gejx7od
做到极致,做到细处
4楼2012-09-15 09:44:23
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Miracle922

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引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2012-09-14 18:47:03
横坐标就是能量。分子体系分子轨道能级是离散的,分子轨道能量是多少,在哪个横坐标位置TDOS上就表示为一个竖条(代表在这里有个能量态),而展宽后,就是一个峰形。

你要做的图是PDOS。由于Multiwfn需要计算出p ...

我看到有文献报道将费米能级定义在HOMO。还有个小问题,在进入fragment1的时候 我用all显示所有的 basis function发现只显示后一半(共有40-80个原子)有什么命令可以分屏显示所有的,或者一次性全部显示完?谢谢,我不知道这个是不是程序的bug
做到极致,做到细处
5楼2012-09-15 17:12:42
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