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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Multiwfn » 如何用multiwfn来求密度差（某个体系的密度减去组成它的各个片段的密度）的极值。
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molx79

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何用multiwfn来求密度差（某个体系的密度减去组成它的各个片段的密度）的极值。 已有1人参与

我尝试的例子是水二聚体和两个单体水的密度差。（复合物（H2O）2.wfn;单体H2O-1.wfn和H2O-2.wfn）
想计算里面的某个原子周围密度差的极值（文献上叫most negative density difference values(e per bohr3)）
求详细做法。以及默认的密度差的单位。
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    • 2014-11-14 13:19:07, 21.33 K

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1楼 2014-11-14 13:20:37
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3, 感谢应助 2014-11-16 05:52:15
molx79: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-11-17 08:01:26
用multiwfn来求密度差，详见：《使用Multiwfn作电子密度差图》  http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3980314
默认的密度差的单位就是：(e per bohr^3)。

most negative（最负值）这样的单点値，应该没有什么实际意义。因此将你的问题转问sobereva博士，她说：
“我不觉得最负的值有什么物理意义，毕竟那只是一个点的数值，说明不了什么问题。
想得到的话，先用主功能5照常做密度差以得到密度差格点数据，算完之后屏幕上就有这样的提示
The minimum is -0.93736224D+00 at  -0.02387   0.03594   0.23631 (Bohr)
说明了整个空间中最负的值和那个点的位置。
但是他说“原子周围”，这就比较含糊，因为没有唯一的方法去划分原子。如果用AIM方法定义原子的空间，从中找最负的值，Multiwfn倒是也能做，不过需要利用一些技巧才能实现（要用到盆分析）。”

对于在空间分布的正値或负値区域，它们可能就分布在某个“原子周围”，这时可以通过Multiwfn作盆分析，求得某个“原子周围”正或负值的具体电子（电荷）数量，它是这个“原子周围”增加或减少的电子（电荷）数量。
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2楼2014-11-15 11:21:09
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molx79

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2014-11-15 11:21:09
用multiwfn来求密度差，详见：《使用Multiwfn作电子密度差图》  http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3980314
默认的密度差的单位就是：(e per bohr^3)。

most negative（最负值）这样的单点値，应该没有什 ...

非常感谢
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3楼2014-11-17 08:01:44
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