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916756502新虫 (初入文坛)
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patch的用法 已有1人参与
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| 我想连接糖链上两个残基，用patch语句，但是不知道patch语句怎么使用，麻烦指点一下，谢谢啦。 |
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patch 是指当你的结构中包含特殊结构，例如环肽，二硫桥等等，按照 top 文件中的定义，可以对蛋白质/核酸的结构进行修饰。标准用法例如: (1) 对多肽链的一端修饰成N-terminus : patch NTER segid(所设的 segment 变数):resid(第几号残基) (2) 在两个残基间连接二硫键桥 : patch DISU segid:resid 详细用法可以看看这篇 http://simulation.haotui.com/viewthread.php?tid=10227 或者是 NAMD tutorial 后面关于 topology 的部分，或者是直接看 topology tutorial 至于是否能够连接两个残基就不清楚了 |
2楼2014-11-13 16:21:37
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