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dingding9631

金虫 (小有名气)

[求助] DS做多亚基蛋白分子动力学模拟的问题 已有1人参与

大家好,现在要研究一个六聚体蛋白与配体的结合,但是同源建模时只建了其中一个亚基,并用CDOCKER进行配体与蛋白对接。这样的单亚基蛋白再做分子动力学模拟是否很不准确?是否要再构建六聚体模型(这样计算量很大)?
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monsoncupid

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
abinitio: 金币+1, 鼓励交流 2014-11-19 16:34:22
dingding9631: 金币+2 2014-11-20 13:30:39
应该是不准确的,模拟肯定要以实验或者实际情况为基础设定,六聚体共同作用于配体,只模拟一个肯定反映不出来真实情况,做出来也不准
宅若久时天然呆,呆到深处自然萌
2楼2014-11-19 12:27:45
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