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chenwc319木虫 (正式写手)
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Possible racemic twin or wrong absolute struture-try TWIN refinement 已有1人参与
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晶体解析时候，遇到了这个问题：possible racemic twin or wrong absolute struture-try TWIN refinement。 该晶体是Hexagonal, P6(3)手性空间群。加了twin命令后，flack值就是0了，不对。要是不加这个twin这个命令， cif中提示Flack 值是0.355.而且check cif有C类错误： Flack test results are ambiguous. From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack 0.355 From the CIF: _refine_ls_abs_structure_Flack_su 0.011 这个问题应该如何解决，要具体解决办法以及原因。 如果不需要解决，需要解释的话，请说明在cif中如何解释。 谢谢。金币不够可以追加 |
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chenwc319
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3楼2014-10-22 19:52:43
【答案】应助回帖
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1. 非手性分子但确定为手性空间群，同样要做Flack。注意此时的HKL数据应该是没有被平均过的。在shelx程序里面设置 MERG 3，或者重新评价数据选择不平均项。 2. 既非手性分子又不是手性空间群，checking程序是不会问这个问题的，不然就要再次检查空间群是否正确了。 3.如果不是手性空间群，比如p-1等，那么可以直接删除_refine_ls_abs_structure_Flack ，或者在其后加上‘?’ 造成上述警示的原因是简单的twin精修，如果在twin后面加上矩阵就可以解决，twin matrix就可以得到偏差。 比如 twin 1 0 0 0 -1 0 0 0 -1 BASF 0.5 flack 参数就会给出标准偏差。 |
2楼2014-10-22 19:39:02
4楼2014-10-22 20:32:54
chenwc319
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5楼2014-10-23 08:32:43
