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shellyxss

金虫 (正式写手)

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[求助] 细菌基因组测序成本到底有多少？已有8人参与

如题，一上来就是好几万，难道成本真的很高？还是说基因组测序这个行业潜规则就是这样？

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1楼 2014-10-21 10:38:19

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664183455

新虫 (初入文坛)

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专业: 基因组学

【答案】应助回帖

做细菌基因组测序，得看你的细菌是否有参考基因组，如果有参考基因组的话，而且这种细菌的突变、缺失等不太多，价格就是上面holyala所说的那样。

如果没有参考基因组或者插入缺失等片段太多的话，那就属于denovo测序了，这个也要分精细图和完成图，完成图的话价格好几万也是正常的。做完成图需要先用miseq或者hiseq测序（最好是Pair end）组装成一个个contig，然后是scaffold，目前经常采取的还要加上三代Pacbio的长度长来保证组装成功，算下来是要几万元的。