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patrickplus

铜虫 (初入文坛)

[求助] 问一下克隆时时遇到基因的不同isoform 如何选择? 已有1人参与

问一下克隆时时遇到基因的不同isoform 如何选择?一直有这个疑问,有没有什么网站或者文献可以查询哪个isoform最常用吗? 举个栗子,我需要克隆一个去泛素酶USP19到真核表达载体,这个基因有4个isoform,如何能找出哪个是最常用的?我看了相关文献也没有记载。要不就随便挑一个做?  请指点,非常感谢!

问一下克隆时时遇到基因的不同isoform 如何选择?
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junior850621

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2014-10-22 10:03:11
引用回帖:
3楼: Originally posted by patrickplus at 2014-10-21 12:43:01
每个isoform都有对应的蛋白序列,长度还是有点小区别的,看来只能通过文献来确定哪个isoform最常用,有没有现成的primer了...

建议找水平高一点的杂志的文章。我还真见到过一篇,里面给的引物根本就不是那个基因的,忘了是什么杂志,但一作是位日本女生。还好我在文章里找的东西都自己blast一下,要不然就麻烦了。建议你也做一下。
4楼2014-10-22 00:45:00
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junior850621

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-10-21 13:09:50
这是mRNA水平,需要看cDNA的部分有差别吗?没有已发表文章里面能查到的引物吗?
2楼2014-10-18 22:19:32
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patrickplus

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by junior850621 at 2014-10-18 22:19:32
这是mRNA水平,需要看cDNA的部分有差别吗?没有已发表文章里面能查到的引物吗?

每个isoform都有对应的蛋白序列,长度还是有点小区别的,看来只能通过文献来确定哪个isoform最常用,有没有现成的primer了
3楼2014-10-21 12:43:01
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patrickplus

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by junior850621 at 2014-10-22 00:45:00
建议找水平高一点的杂志的文章。我还真见到过一篇,里面给的引物根本就不是那个基因的,忘了是什么杂志,但一作是位日本女生。还好我在文章里找的东西都自己blast一下,要不然就麻烦了。建议你也做一下。...

非常感谢您的提醒!确实得验证一下
5楼2014-10-23 10:10:29
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