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patrickplus

铜虫 (初入文坛)

[求助] 问一下克隆时时遇到基因的不同isoform 如何选择？ 已有1人参与

问一下克隆时时遇到基因的不同isoform 如何选择？一直有这个疑问，有没有什么网站或者文献可以查询哪个isoform最常用吗？ 举个栗子，我需要克隆一个去泛素酶USP19到真核表达载体，这个基因有4个isoform,如何能找出哪个是最常用的？我看了相关文献也没有记载。要不就随便挑一个做？  请指点，非常感谢！

问一下克隆时时遇到基因的不同isoform 如何选择？
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1楼 2014-10-15 13:05:06
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junior850621

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-10-21 13:09:50
这是mRNA水平，需要看cDNA的部分有差别吗？没有已发表文章里面能查到的引物吗？
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2楼2014-10-18 22:19:32
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patrickplus

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by junior850621 at 2014-10-18 22:19:32
这是mRNA水平，需要看cDNA的部分有差别吗？没有已发表文章里面能查到的引物吗？

每个isoform都有对应的蛋白序列，长度还是有点小区别的，看来只能通过文献来确定哪个isoform最常用，有没有现成的primer了
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3楼2014-10-21 12:43:01
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junior850621

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-10-22 10:03:11
引用回帖:
3楼: Originally posted by patrickplus at 2014-10-21 12:43:01
每个isoform都有对应的蛋白序列，长度还是有点小区别的，看来只能通过文献来确定哪个isoform最常用，有没有现成的primer了...

建议找水平高一点的杂志的文章。我还真见到过一篇，里面给的引物根本就不是那个基因的，忘了是什么杂志，但一作是位日本女生。还好我在文章里找的东西都自己blast一下，要不然就麻烦了。建议你也做一下。
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4楼2014-10-22 00:45:00
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patrickplus

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by junior850621 at 2014-10-22 00:45:00
建议找水平高一点的杂志的文章。我还真见到过一篇，里面给的引物根本就不是那个基因的，忘了是什么杂志，但一作是位日本女生。还好我在文章里找的东西都自己blast一下，要不然就麻烦了。建议你也做一下。...

非常感谢您的提醒！确实得验证一下
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5楼2014-10-23 10:10:29
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