应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 关于VASP+phonopy计算声子过程的讨论
51/1返回列表
查看: 2728  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

Brilliantly

捐助贵宾 (正式写手)

[求助] 关于VASP+phonopy计算声子过程的讨论

我按照phonopy的官网说明书计算一个化合物的声子，现在已经用命令phonopy -d --dim="2 2 3"产生了以下文件：disp.yaml POSCAR POSCAR-001 POSCAR-002 POSCAR-003 SPOSCAR。然后我将POSCAR-001 POSCAR-002 POSCAR-003分别改名为POSCAR在VASP下分别得到了三个不同的vasprun.xml，下面我看说明书就有点看不懂了，说明书写的是用命令phonopy -f disp-001/vasprun.xml disp-002/vasprun.xml disp-003/vasprun.xml，我现在有点不明白这个disp-001、disp-002、disp-003是什么文件呢？还有就是这三个POSCAR-001 POSCAR-002 POSCAR-003不是分别对应一个vasprun.xml吗？那这个命令中的vasprun.xml究竟是指哪个呢？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

第一性原理相关文档 VASP 第一性原理计算-tg

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
加油！
1楼 2014-10-13 20:02:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rnchen

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by rnchen at 2014-10-13 22:40:20
具体是，比如你把POSCAR001复制到disp001文件夹下，重命名为POSCAR然后把计算能量的INCAR POTCAR KPONITS复制过来算能量。同样处理所有其他的POSCAR00*，计算完所有的最后你就会得到所有的vasprun.xml，然后就可以 ...

命令的vasprun.xml需要所有的poscar对应的vasprun.xml

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
4楼2014-10-13 22:41:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

rnchen

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你把不同的POSCAR分别复制到一个文件夹，在这里就是disp00*然后分别算能量。最后在每个文件夹下就有一个vasprun.xml

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
2楼2014-10-13 22:37:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rnchen

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
Brilliantly: 金币+15, ★★★★★最佳答案, 感谢您如此快而清楚的回复，真的十分感谢！ 2014-10-14 00:44:22
引用回帖:
2楼: Originally posted by rnchen at 2014-10-13 22:37:22
你把不同的POSCAR分别复制到一个文件夹，在这里就是disp00*然后分别算能量。最后在每个文件夹下就有一个vasprun.xml

具体是，比如你把POSCAR001复制到disp001文件夹下，重命名为POSCAR然后把计算能量的INCAR POTCAR KPONITS复制过来算能量。同样处理所有其他的POSCAR00*，计算完所有的最后你就会得到所有的vasprun.xml，然后就可以用phonopy了

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
3楼2014-10-13 22:40:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dx0620

木虫 (正式写手)
上面回答的是正确的，不过我们都是通过脚本计算的，建超胞后产生两个超胞的
for a in 01 02
do
cp POSCAR-0$a POSCAR
vasp
cp vasprun.xml vasprun.xml-0$a
done
这样最后就运行phonopy -f vasprun.xml-0*就可以了
赞一下(4人) 回复此楼
5楼2014-10-14 08:31:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 欢迎采矿、地质、岩土、计算机、人工智能等专业的同学报考 +4 pin8023 2026-02-28 6/300 2026-03-02 06:35 by 汪！？！
[基金申请] 本子写完了，给DS兄弟看了，得了92分 +3 Doma 2026-03-01 7/350 2026-03-02 00:00 by jnzsy
[考研] 求调剂 +5 yunziaaaaa 2026-03-01 6/300 2026-03-01 23:57 by ccp273206157
[考研] 江苏省农科院招调剂1名 +3 Qwertyuop 2026-03-01 3/150 2026-03-01 23:18 by aaadim
[考研] 265分求调剂不调专业和学校有行学上就 +6 礼堂丁真258 2026-02-28 8/400 2026-03-01 22:50 by jian_
[基金申请] 成果系统访问量大，请一小时后再尝试。---NSFC啥时候好哦，已经两天这样了 +4 NSFC2026我来了 2026-02-28 4/200 2026-03-01 22:37 by 铁门栓
[硕博家园] 博士自荐 +7 科研狗111 2026-02-26 11/550 2026-03-01 22:24 by 哲平L
[考研] 26考研报考西工大材料308分求调剂 +3 weizhong123 2026-03-01 3/150 2026-03-01 21:42 by 公瑾逍遥
[考研] 0856求调剂285 +10 吕仔龙 2026-02-28 10/500 2026-03-01 21:37 by 公瑾逍遥
[考研] 一志愿中南大学理学化学 +4 15779376950 2026-03-01 5/250 2026-03-01 19:00 by Fff-1
[考研] 0856材料求调剂 +11 hyf hyf hyf 2026-02-28 12/600 2026-03-01 18:57 by 18137688336
[考博] 26申博 +4 想申博！ 2026-02-26 6/300 2026-03-01 17:32 by 想申博！
[考研] 281求调剂 +4 2026计算机_诚心 2026-03-01 7/350 2026-03-01 17:20 by 2026计算机_诚心
[考研] 311求调剂 +6 亭亭亭01 2026-03-01 6/300 2026-03-01 15:41 by 324616
[考研] 303求调剂 +4 今夏不夏 2026-03-01 4/200 2026-03-01 14:46 by 嘟嘟小浣熊
[考研] 材料284求调剂，一志愿郑州大学英一数二专硕 +10 想上岸的土拨鼠 2026-02-28 10/500 2026-03-01 14:12 by yc258
[考研] 302材料工程求调剂 +4 Doleres 2026-03-01 5/250 2026-03-01 11:52 by liqiongjy
[论文投稿] Optics letters投稿被拒求助 30+3 luckyry 2026-02-26 4/200 2026-03-01 09:06 by babero
[考研] 264求调剂 +3 巴拉巴拉根556 2026-02-28 3/150 2026-02-28 21:31 by gaoxiaoniuma
[考研] 276求调剂 +3 路lyh123 2026-02-28 4/200 2026-02-28 19:45 by 路lyh123
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭