24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2772  |  回复: 6

Brilliantly

捐助贵宾 (正式写手)

[求助] 关于VASP+phonopy计算声子过程的讨论

我按照phonopy的官网说明书计算一个化合物的声子,现在已经用命令phonopy -d --dim="2 2 3"产生了以下文件:disp.yaml POSCAR POSCAR-001 POSCAR-002 POSCAR-003 SPOSCAR。然后我将POSCAR-001 POSCAR-002 POSCAR-003分别改名为POSCAR在VASP下分别得到了三个不同的vasprun.xml,下面我看说明书就有点看不懂了,说明书写的是用命令phonopy -f disp-001/vasprun.xml disp-002/vasprun.xml disp-003/vasprun.xml,我现在有点不明白这个disp-001、disp-002、disp-003是什么文件呢?还有就是这三个POSCAR-001 POSCAR-002 POSCAR-003不是分别对应一个vasprun.xml吗?那这个命令中的vasprun.xml究竟是指哪个呢?
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

第一性原理相关文档 VASP 第一性原理计算-tg

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

加油!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rnchen

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你把不同的POSCAR分别复制到一个文件夹,在这里就是disp00*然后分别算能量。最后在每个文件夹下就有一个vasprun.xml

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-10-13 22:37:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rnchen

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
Brilliantly: 金币+15, ★★★★★最佳答案, 感谢您如此快而清楚的回复,真的十分感谢! 2014-10-14 00:44:22
引用回帖:
2楼: Originally posted by rnchen at 2014-10-13 22:37:22
你把不同的POSCAR分别复制到一个文件夹,在这里就是disp00*然后分别算能量。最后在每个文件夹下就有一个vasprun.xml

具体是,比如你把POSCAR001复制到disp001文件夹下,重命名为POSCAR然后把计算能量的INCAR POTCAR KPONITS复制过来算能量。同样处理所有其他的POSCAR00*,计算完所有的最后你就会得到所有的vasprun.xml,然后就可以用phonopy了

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-10-13 22:40:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rnchen

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by rnchen at 2014-10-13 22:40:20
具体是,比如你把POSCAR001复制到disp001文件夹下,重命名为POSCAR然后把计算能量的INCAR POTCAR KPONITS复制过来算能量。同样处理所有其他的POSCAR00*,计算完所有的最后你就会得到所有的vasprun.xml,然后就可以 ...

命令的vasprun.xml需要所有的poscar对应的vasprun.xml

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2014-10-13 22:41:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dx0620

木虫 (正式写手)

上面回答的是正确的,不过我们都是通过脚本计算的,建超胞后产生两个超胞的
for a in 01 02
do
cp POSCAR-0$a POSCAR
vasp
cp vasprun.xml vasprun.xml-0$a
done
这样最后就运行phonopy -f vasprun.xml-0*就可以了
5楼2014-10-14 08:31:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Brilliantly

捐助贵宾 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by dx0620 at 2014-10-14 08:31:21
上面回答的是正确的,不过我们都是通过脚本计算的,建超胞后产生两个超胞的
for a in 01 02
do
cp POSCAR-0$a POSCAR
vasp
cp vasprun.xml vasprun.xml-0$a
done
这样最后就运行phonopy -f vasprun.xml-0*就 ...

你没有应助所以没办法评分啊,所以送了你两朵小红花以表示感谢!
加油!
6楼2014-10-14 09:29:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

NickyHCQ

木虫 (正式写手)

7楼2016-11-19 10:18:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Brilliantly 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂 +6 小聂爱学习 2026-04-11 9/450 2026-04-11 21:20 by 蓝云思雨
[考研] 343求调剂 +9 王国帅 2026-04-10 9/450 2026-04-11 20:31 by dongdian1
[考研] 359求调剂 +5 胃痉挛累了 2026-04-11 5/250 2026-04-11 19:55 by lbsjt
[考研] 电子信息270求调剂 +14 terminal469 2026-04-07 14/700 2026-04-11 19:44 by laoshidan
[考研] 一志愿郑州大学 22408 305分求调剂 +4 安小满zzz 2026-04-08 4/200 2026-04-11 11:52 by zhq0425
[考研] 085410-273求调剂 +6 X1999 2026-04-10 6/300 2026-04-11 10:32 by Delta2012
[考研] 22408 327分求调剂 +4 韵风kon 2026-04-10 4/200 2026-04-11 09:51 by 猪会飞
[考研] 复试调剂 +9 积极向上; 2026-04-10 11/550 2026-04-11 09:25 by 猪会飞
[考研] 263能源动力专硕求调剂 +3 加大号饭盒袋 2026-04-10 3/150 2026-04-10 22:23 by 286640313
[考研] 301求调剂 +5 149. 2026-04-10 5/250 2026-04-10 15:45 by 柴小白
[考研] 机械专368 有去处吗 +4 种大树 2026-04-10 4/200 2026-04-10 15:31 by jiajinhpu
[考研] 一志愿中南大学物理学,英一66,求调剂 +4 长烟旖旎 2026-04-08 5/250 2026-04-10 10:31 by 颖果儿
[考研] 本科郑州大学,一志愿华东师范大学282求调剂 +23 熊哥xtk 2026-04-07 26/1300 2026-04-09 17:17 by 18446523
[考研] 招收有机化学、化工,药学,食品灯专业学生 +3 yrfhjgdj 2026-04-08 3/150 2026-04-09 10:15 by QYQX_123
[考研] 264求调剂 +11 麦小叮当 2026-04-07 11/550 2026-04-08 16:05 by 一只好果子?
[考研] 307求调剂 +14 超级伊昂大王 2026-04-06 14/700 2026-04-08 07:03 by 无际的草原
[考研] 338求调剂 +5 小猪红色 678 2026-04-06 6/300 2026-04-07 21:18 by 乔哒哒哒
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358求调剂 +10 cs0106 2026-04-05 12/600 2026-04-06 19:41 by 无际的草原
[考研] 307求调剂 +3 所念及所望 2026-04-06 3/150 2026-04-06 17:30 by 土木硕士招生
[考研] 工科277分求调剂材料 +8 上了上了上哦 2026-04-05 9/450 2026-04-05 13:05 by wwytracy
信息提示
请填处理意见