| 查看: 2427 | 回复: 9 | ||
[求助]
第一次接触PBS新人求助.. 已有1人参与
|
|
第一次接触PBS，提交的任务想要实现一个这样的功能： 调用集群中的Matlab，然后使用Matlab调用一个名字叫做EnKF.m的函数。 小弟是做数据同化的，所以EnKF.m这个函数里面包含着100个海洋模型的调用... 不知道计算量不同，pbs里面的语句也会有变化，所以也列出来了。 我自己根据网上的材料，参考改写的程序如下： #!/bin/bash -x #PBS -N EnKF #PBS -l nodes=1:ppn=4 #PBS -l walltime=10:00:00 cd /lustre/users/eeslsy/LB/Assim3D2014v6/ECOM nohup matlab -nojvm -nodisplay -nosplash -nodesktop < EnKF.m 1>running.log 2>running.err 提示的错误信息是： qsub: Job rejected by all possible destinations 现在想要求高手帮忙修改... 比较着急，再加上有点外行，让大家见笑了。  补充集群返回的running.error提示我： {??? Main directory doesnot exist: } {??? Undefined function or variable 'create_kfparamstruct'. } 其中的create_kfparamstruct是我的一个m函数，不知道为什么好像调用不了... |
回复此楼» 猜你喜欢
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有17人回复
-
基金不中，共勉
已经有10人回复
-
青基如何破局
已经有6人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有11人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有7人回复
-
基金未中，这种答复是模板吗？
已经有6人回复
-
看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉……
已经有6人回复
-
导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！
已经有6人回复
-
怎么看青基中了没有啊
已经有5人回复
-
梦想
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 做过硼氢化锌还原的虫子进，求赐教
已经有3人回复
2楼2014-10-01 15:34:33
3楼2014-10-02 09:33:47
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
fzx2008: 金币+5, 谢谢指导 2014-10-02 21:50:37
酱油哥男二号: 金币+30, ★★★很有帮助 2014-10-04 13:37:28
酱油哥男二号: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2014-10-15 17:00:46
感谢参与，应助指数 +1
fzx2008: 金币+5, 谢谢指导 2014-10-02 21:50:37
酱油哥男二号: 金币+30, ★★★很有帮助 2014-10-04 13:37:28
酱油哥男二号: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2014-10-15 17:00:46
|
??????? ????C???? PBE ?O???????????????Щ?S??? ?????n????????? #!/bin/bash -x #PBS -N EnKF #PBS -l nodes=1:ppn=4 #PBS -l walltime=10:00:00 ??????]????? queue ???????|??C????????? ?? PBE ?O????????????? queue ????? queue ???в??????? (??Щ queue ???O???o?????JOB????Щqueue ???O???o??????w?? JOB) ??????fJOB?n??????????????o?? queue ?????? ???? #PBS -q long ?@??????o?L?r?g??JOB (long) #PBS -q bigmem ?@??????o????|?w??JOB (bigmem) ????????S???????????????C?????????????O?? (?@Щ??????????b?????o??) ???????Щ?C?????????N queue ??????????????????????} ????C???????N????? queue?? ????????????????y???? |
4楼2014-10-02 15:13:30
5楼2014-10-14 15:30:51
6楼2014-10-14 15:41:11
7楼2014-10-15 17:02:37
|
??? ??? ??????????MPI???е??????????.. ???????????????????????????100?????????????????MPI?????????for???????????????????????????????????????????CPU??????? ?????????? MPI_Init( &argc, &argv ); MPI_Comm_rank( MPI_COMM_WORLD, &myid ); MPI_Comm_size( MPI_COMM_WORLD, &numprocs ); for i = 1:5 system(test(i)) end MPI_Finalize(); ???????????????????????????test??1????test??2????...??test??5?? ?????test??1????????5????????????????.. ??????????????????????? |
8楼2014-10-21 21:00:18
9楼2014-10-21 21:40:48
10楼2014-10-22 11:16:35
10