24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1542  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

幻亦真

铜虫 (初入文坛)

[求助] 请教一下量化计算大约3000个原子的多肽体系 已有3人参与

我要计算的多肽体系大约3000个原子, 包含C H O N S这五种原子。 因为体系太大,所以要使用oniom方法去计算。但是高层(high level)也有300个原子。原子太多,计算不动啊。请教高手~~
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongleli

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2014-10-06 05:27:50
引用回帖:
2楼: Originally posted by agent99 at 2014-10-01 00:16:33
有化学反应吗?没有的话用分子力学吧

我们科研人员思维要不断更新。
现在大体系的量化计算发展很快。比如Greg Voth, John Z H Zhang这两派人过去做过的分块量化计算方法最近几年又有新发展。Todd Martinez弄出来的计算软件可以做蛋白质的直接QM计算(Born-Oppenheimer dynamics)。
7楼2014-10-06 02:57:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

agent99

禁虫 (正式写手)

物化程序猿

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+1 2014-10-01 23:55:00
幻亦真: 金币+1 2014-10-03 18:26:35
有化学反应吗?没有的话用分子力学吧
理论与计算化学,化学物理,生物物理
2楼2014-10-01 00:16:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongleli

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
幻亦真: 金币+1 2014-10-03 18:26:43
请使用Todd Martinez的程序
http://www.petachem.com/products.html
前提是你有GPU
3楼2014-10-02 04:50:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dreamyeye

木虫 (著名写手)

听说现在超算中心的机群都能处理几亿个原子的体系了,是真的吗?
4楼2014-10-03 16:18:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 320分,材料与化工专业,求调剂 +5 一定上岸aaa 2026-03-27 7/350 2026-03-27 22:21 by 一定上岸aaa
[考研] 277跪求调剂 +5 1915668 2026-03-27 8/400 2026-03-27 19:53 by WYUMater
[考研] 求调剂推荐 材料 304 +14 荷包蛋hyj 2026-03-26 14/700 2026-03-27 17:49 by kiokin
[考研] 0703化学 +6 妮妮ninicgb 2026-03-27 6/300 2026-03-27 17:18 by shangxh
[考研] 279 分 求调剂 +4 睡个好觉_16 2026-03-24 4/200 2026-03-27 15:05 by 醉在风里
[考研] 276求调剂。有半年电池和半年高分子实习经历 +10 材料学257求调剂 2026-03-23 11/550 2026-03-27 10:13 by YCIT- LHL
[考研] 一志愿陕师大生物学071000,298分,求调剂 +5 SYA! 2026-03-23 5/250 2026-03-27 09:29 by 不吃魚的貓
[考研] 336材料求调剂 +7 陈滢莹 2026-03-26 9/450 2026-03-27 00:20 by wxiongid
[考研] 一志愿211 初试270分 求调剂 +6 谷雨上岸 2026-03-23 7/350 2026-03-26 18:55 by 不吃魚的貓
[考研] 334分 一志愿武理 材料求调剂 +4 李李不服输 2026-03-26 4/200 2026-03-26 16:00 by 不吃魚的貓
[考研] 085600 材料与化工 329分求调剂 +9 Mr. Z 2026-03-25 9/450 2026-03-26 10:36 by baoball
[考研] 化学调剂一志愿上海交通大学336分-本科上海211 +4 小鱼爱有机 2026-03-25 4/200 2026-03-26 10:19 by aa331100
[考研] 303求调剂 +6 蓝山月 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:47 by 418490947
[考研] 07化学303求调剂 +5 睿08 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:46 by 418490947
[考研] 求调剂 +3 QiMing7 2026-03-25 3/150 2026-03-25 21:13 by 给你你注意休息
[考研] 0703化学求调剂 +6 奶油草莓. 2026-03-22 7/350 2026-03-25 10:00 by shangxh
[考研] 318求调剂 +3 plum李子 2026-03-23 3/150 2026-03-25 09:42 by 雾散后相遇lc
[考研] 318求调剂 +5 plum李子 2026-03-21 8/400 2026-03-25 09:26 by aa331100
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-21 6/300 2026-03-24 15:03 by 余意卿
[考研] 求调剂一志愿海大,0703化学学硕304分,有大创项目,四级已过 +6 幸运哩哩 2026-03-22 10/500 2026-03-22 20:10 by edmund7
信息提示
请填处理意见