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chen726721

金虫 (小有名气)

[求助] diamond作图 已有3人参与

大家好,刚接触diamond,不知道怎么使用。现有cif文件,用diamond打开后是第一张图这样,想问一下怎么画出图2这种只有一个分子的图,具体操作步骤,感激不尽。。

diamond作图
1.jpg


diamond作图-1
2.jpg
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zytcat

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chen726721: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-09-25 20:54:49
首先点第12个红色叉的按钮把图1 中的原子删除,然后点第2个按钮,就会有原子出来,然后点第5个,就把分散的原子连接起来了,此时你看看是不是你要的分子结构,如何结构没有长全,你就选中原子,点击第7个按钮(是长原子的),这样剩余的结构就长出来了
diamond作图-2
anniu2.jpg

3楼2014-09-25 11:32:54
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查看全部 11 个回答

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chen726721: 金币+2, 有帮助 2014-09-25 20:54:11
试试先destroy all在get molecules。这样应该会出现一个分子,如果不行可以手动删除一下。
学无止境
2楼2014-09-24 22:19:59
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骓兮之清

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zytcat at 2014-09-25 11:32:54
首先点第12个红色叉的按钮把图1 中的原子删除,然后点第2个按钮,就会有原子出来,然后点第5个,就把分散的原子连接起来了,此时你看看是不是你要的分子结构,如何结构没有长全,你就选中原子,点击第7个按钮(是长 ...

最好点击第四个估算一下,再连接,点击第四个,会出来一个对话框,点击估算,然后会自动选择哪些原子连接,然后点连接,就好了
4楼2014-09-25 15:47:52
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chen726721

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cluster8676 at 2014-09-24 22:19:59
试试先destroy all在get molecules。这样应该会出现一个分子,如果不行可以手动删除一下。

非常感谢
5楼2014-09-25 20:54:23
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