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chen726721

金虫 (小有名气)

[求助] diamond作图 已有3人参与

大家好，刚接触diamond，不知道怎么使用。现有cif文件，用diamond打开后是第一张图这样，想问一下怎么画出图2这种只有一个分子的图，具体操作步骤，感激不尽。。

diamond作图
1.jpg


diamond作图-1
2.jpg
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1楼 2014-09-24 21:45:05
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

zytcat

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chen726721: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-09-25 20:54:49
首先点第12个红色叉的按钮把图1 中的原子删除，然后点第2个按钮，就会有原子出来，然后点第5个，就把分散的原子连接起来了，此时你看看是不是你要的分子结构，如何结构没有长全，你就选中原子，点击第7个按钮（是长原子的），这样剩余的结构就长出来了
diamond作图-2
anniu2.jpg
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3楼2014-09-25 11:32:54
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骓兮之清

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zytcat at 2014-09-25 11:32:54
首先点第12个红色叉的按钮把图1 中的原子删除，然后点第2个按钮，就会有原子出来，然后点第5个，就把分散的原子连接起来了，此时你看看是不是你要的分子结构，如何结构没有长全，你就选中原子，点击第7个按钮（是长 ...

最好点击第四个估算一下，再连接，点击第四个，会出来一个对话框，点击估算，然后会自动选择哪些原子连接，然后点连接，就好了
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4楼2014-09-25 15:47:52
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普通回帖

cluster8676

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chen726721: 金币+2, ★有帮助 2014-09-25 20:54:11
试试先destroy all在get molecules。这样应该会出现一个分子，如果不行可以手动删除一下。
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学无止境
2楼2014-09-24 22:19:59
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chen726721

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cluster8676 at 2014-09-24 22:19:59
试试先destroy all在get molecules。这样应该会出现一个分子，如果不行可以手动删除一下。

非常感谢
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5楼2014-09-25 20:54:23
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chen726721

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zytcat at 2014-09-25 11:32:54
首先点第12个红色叉的按钮把图1 中的原子删除，然后点第2个按钮，就会有原子出来，然后点第5个，就把分散的原子连接起来了，此时你看看是不是你要的分子结构，如何结构没有长全，你就选中原子，点击第7个按钮（是长 ...

嗯嗯 试了一下 可以的 一下子觉得也不是那么难了
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6楼2014-09-25 20:55:15
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chen726721

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 骓兮之清 at 2014-09-25 15:47:52
最好点击第四个估算一下，再连接，点击第四个，会出来一个对话框，点击估算，然后会自动选择哪些原子连接，然后点连接，就好了...

谢谢
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7楼2014-09-25 20:55:37
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范二青年

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
chen726721: 金币+3, ★有帮助 2014-09-28 16:02:13
导入cif的之后会出现 create structure picture 对话框，下一步 之后你选择 create molecule 就行了。出现你上图的样子应该是你选择的 create packing diagram。
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什么情况嘛
8楼2014-09-28 08:36:21
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阳光的影子

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 范二青年 at 2014-09-28 08:36:21
导入cif的之后会出现 create structure picture 对话框，下一步 之后你选择 create molecule 就行了。出现你上图的样子应该是你选择的 create packing diagram。

大神麻烦帮我传一个diamond软件吧，非常感谢，找了一晚上下载的都不对
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9楼2014-09-29 18:31:48
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阳光的影子

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by chen726721 at 2014-09-25 20:55:37
谢谢...

楼主麻烦帮我传一份diamond这个软件把，我下载的都不对啊
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10楼2014-09-29 18:32:24
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