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蔡元浩

铁虫 (小有名气)

[求助] 散尽金币!跪求MS建立水分子晶胞的详细过程! 已有3人参与

如题所示,本人这些天一直在学习MS,可是到了真正用的时候却问题百出,一个水分子的晶胞竟都建不起来,其中的问题很多都搞不清白,比如
1,导入CIF文件,calculate bonds 出现一个氧原子上连有四个氢原子
有些虫友建议我把多余的氢原子删掉,可是由于对称性,删掉一个相当于把所有的与他对称的氢原子全部删掉了,
2,手动输入晶格参数,然后只输入氧原子坐标,手动画出氢原子,同样一个氧原子上会连接多个氢原子,
3,同样的方法建立的尿素晶胞非常完美,再用到水分子上是就显得行不通了,
诸如此类的问题,之前发过先关的帖子,虫友们也给了一些建议,但是自身比较愚笨,至今还没有解决,希望路过的虫友们帮帮忙,提供一下详细过程,最好加图示,在下感激不尽!
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jerkwin

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
http://jerkwin.github.io/2013/12 ... %E6%96%87%E4%BB%B6/

冰Ih中的H原子处于无序状态
5楼2014-09-16 21:55:44
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查看全部 7 个回答
2楼2014-09-16 13:24:21
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zyjsky01

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
取消对称性,再删除多余的原子
活好当下
3楼2014-09-16 17:05:45
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蔡元浩

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zyjsky01 at 2014-09-16 17:05:45
取消对称性,再删除多余的原子

能不能说下怎么取消他的对称性,
机会总是留给有准备得人!
4楼2014-09-16 17:17:41
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