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cekiv

新虫 (初入文坛)

应助: 5 (幼儿园)
金币: 10
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在线: 5.9小时
虫号: 1545443
注册: 2011-12-21
专业: 生物信息学

[求助] 如何从转录组测序结果中获取一个基因的序列？已有4人参与

已有某物种转录组测序结果，某基因部分cDNA序列
希望获得该基因cDNA全部序列

本人菜鸟，求具体操作过程和工具，谢谢

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1楼 2014-09-10 16:31:32

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LBXMC

铁虫 (初入文坛)

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虫号: 2789624
注册: 2013-11-09
性别: MM
专业: 生物海洋学与海洋生物资源

引用回帖:

8楼: Originally posted by stone2239 at 2015-11-30 19:54:17
1.看有没有完整ORF
2.用找到的ORF翻译的蛋白做blastp比对，看你的蛋白和数据库蛋白比对区域区间是否一致...

您好，求教！！！
我是这种情况，把确定要做基因X之后，在在我的转录组库里找了已经ANNOTATION到某具体物种的核酸序列，把它放到NCBIx比对，和一个别人已经发表的不同物种的蛋白比上了，但是请问我该怎么找到相对应的保守序列来设计引物做RACE呢（前提是我库里找到的序列已经找过ORF区，但是非常短，应该不是）