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xxj9618银虫 (初入文坛)
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[求助]
我想用一个软件实现肽链和一个烷基侧链的链接 已有1人参与
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| 我现在要做一个模拟，其中要用到的主要物质是一条肽链，但是这个肽链的侧链有一个烷基基团，我想请问一下有没有什么软件可以实现让一个侧链连在肽链上，并且我要生成它的pdb文件 |
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xxj9618
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额，好吧，我自己来，不过我现在遇到这样的问题 Fatal error: Atom HN1 in residue VAL 1 was not found in rtp entry VAL with 10 atoms while sorting atoms. For a hydrogen, this can be a different protonation state, or it might have had a different number in the PDB file and was rebuilt (it might for instance have been H3, and we only expected H1 & H2). Note that hydrogens might have been added to the entry for the N-terminus. Remove this hydrogen or choose a different protonation state to solve it. Option -ignh will ignore all hydrogens in the input. 我知道肯定是因为用己基替换了h导致的，但是我不知道现在该怎么办 |
24楼2014-09-17 13:59:55
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2楼2014-09-10 17:10:43
xxj9618
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3楼2014-09-11 09:22:12
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xxj96184楼2014-09-11 10:11:08