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101702763

金虫 (正式写手)

[求助] checkcif检查出来有A类错误 已有2人参与

Alert level A
PLAT305_ALERT_2_A Isolated Hydrogen Atom (Outside Bond Range ??)          H3B Check
PLAT415_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-X       H3A    ..  H3B     ..       0.99 Ang.  
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H3A    ..  H3A     ..       1.59 Ang.

拜托拜托,哪位大神可以给解答一下,十分感谢!
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Be led by your dreams, not pushed by your problems.
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xja1830

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
PLAT305,孤立氢原子,如果是活泼氢,不dfix会到处跑,成为孤立氢,PLAT415,加氢错误,建议删掉重新选用方法加氢。明显X-H键长不对。
以一颗执着不变的心,勇往直前,迎向未来。
2楼2014-09-06 16:16:06
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jackdeng

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
H3A和H3B加的有问题,可能你在精修的时候没有用dfix命令限制,使得H3B远离了母原子,进而导致了氢键不合理。
3楼2014-09-09 08:21:56
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