应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 构建发育树 好奇怪的样子 自己的序列在一个分支上 已经捣鼓四天了
71/1返回列表
查看: 791  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

樊樊

铜虫 (小有名气)

[求助] 构建发育树 好奇怪的样子 自己的序列在一个分支上 已经捣鼓四天了 已有3人参与

测序回来  NCBI上比对   相似性都在99%以上   每个序列挑选两个到三个相似菌株序列   用MEGA5建发育树   结果是   自己的菌株在一个分支上   下载下来的序列在一个分支上，搞不懂为什么    这几天陆续试了各种方法    去下载了模式菌株   结果还是一样的   
我的序列长度在750bp左右，怎么破   各位大神

构建发育树 好奇怪的样子  自己的序列在一个分支上  已经捣鼓四天了
360截图20140904223922265.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-09-04 22:41:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-09-04 23:49:07
"每个序列挑选两个到三个相似菌株序列"是什么意思？不在一个分支上说明遗传距离远。另外，看你选的序列有的是全长，有的是部分，应该用对应等长的序列建树。
赞一下 回复此楼
2楼2014-09-04 23:19:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

andylihuilai

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有两种可能，一种是你的序列是反向的，需要反向互补一下再建树，另一种情况是你是克隆测序的，序列两端还含有载体序列。
赞一下 回复此楼
3楼2014-09-05 10:25:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

樊樊

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by andylihuilai at 2014-09-05 10:25:09
有两种可能，一种是你的序列是反向的，需要反向互补一下再建树，另一种情况是你是克隆测序的，序列两端还含有载体序列。

反向互补之类的我都试过了，没用
确实是克隆测序   可是我已经把载体序列去掉了啊   怎么还是这样啊
赞一下 回复此楼
4楼2014-09-05 10:33:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

樊樊

铜虫 (小有名气)
顶顶
回复此楼
5楼2014-09-05 14:51:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jkamm

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
貌似同源性好高，99%，应就是同一个东东了吧。
赞一下 回复此楼
6楼2014-09-05 16:12:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

樊樊

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by jkamm at 2014-09-05 16:12:23
貌似同源性好高，99%，应就是同一个东东了吧。

我也是这么认为的啊，可是用MEGA建树出来  距离离得好远
赞一下 回复此楼
7楼2014-09-05 18:26:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 樊樊 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +3 bud_bud 2026-08-27 6/300 2026-08-28 11:53 by bud_bud
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+5) +12 晴天加油 2026-08-26 13/650 2026-08-28 11:32 by skyjudy
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +7 苏东坡二世 2026-08-23 7/350 2026-08-27 18:14 by 瞬息宇宙
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭