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ggyy0911

铁虫 (正式写手)

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[求助] 新手求助！怎么给多亚基且不相同的酶建模？？

想对一个已经截短的酶建模，4个亚基，第5个截了。
  SWISS-Model同源建模的时候，搜索出的模板有五个亚基的全酶，同源性很低，不到30%。
  然后就是同源性很高的一个酶的单独亚基，五个片段，我不懂为什么没有这个酶的全酶模板，只有单独亚基的。
  如果用全酶建模，第一是同源性低；
  第二是建模后我用pymol看，标记肽链只有一条，用swiss难道只能建同源多聚体的蛋白？
  第三是如果用全酶建模，建出来的是5个亚基的话，我的酶截短岂不是没有意义了，再用这个模型去做分子对接不就没意义了。

  再者，搜索出的每个单独模板同源性都很高，那我能用这些单独的亚基去建一个4亚基的蛋白模型吗？
  求助高手啊！！！

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