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配体的质子化状态
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大家好，我正在做一个配体与受体的分子对接，用的软件是autodock 配体是含多个羧基的化合物（不是氨基酸），有手性，在pubchem也找到它的mol2文件 但考虑到羧基的质子化状态可能对对接结果影响比较大，所以有以下两个问题： 1、如何判断配体的质子化状态 2、确定质子化状态后如何修改？autodock可以直接修改吗？或是用其它什么软件？ 谢谢大家！ |
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