应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 请问sybyl的分子动力学Dynamics可以并行么
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
41/1返回列表
查看: 804  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

s1g2k3

铁虫 (小有名气)

[求助] 请问sybyl的分子动力学Dynamics可以并行么 已有1人参与

只用一个核算的好慢，可以几个核一起做么
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
知识总是多的学不完，但是真的艺不压身。
1楼 2014-08-25 10:49:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wbingxin2012

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
s1g2k3: 金币+2, ★有帮助 2014-08-28 13:56:25
SYBYL是可以并行计算的，但是不建议你用SYBYL做分子动力学，甚至说不建议你在图形界面下跑分子动力学，图形界面下跑的话一飞秒输出一帧，那个量太大了，很容易卡死
赞一下 回复此楼
2楼2014-08-27 10:54:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

s1g2k3

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wbingxin2012 at 2014-08-27 10:54:21
SYBYL是可以并行计算的，但是不建议你用SYBYL做分子动力学，甚至说不建议你在图形界面下跑分子动力学，图形界面下跑的话一飞秒输出一帧，那个量太大了，很容易卡死

那该怎么办呀，用哪个软件好，主要是不太会在linux上装软件
赞一下 回复此楼
知识总是多的学不完，但是真的艺不压身。
3楼2014-08-28 13:56:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wbingxin2012

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by s1g2k3 at 2014-08-28 13:56:26
那该怎么办呀，用哪个软件好，主要是不太会在linux上装软件...

分子动力学有专门的软件，AMBER、GROMAS，不同的体系也要用不同的软件，但是不会在Linux下装软件肯定是搞不定了，这些软件都需要懂一些Linux的命令，但是基本上来回就那几个命令来回敲，想学的话也简单。关键是软件的使用和结果分析这才是重点难点
赞一下 回复此楼
4楼2014-09-01 13:28:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 s1g2k3 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 359求调剂 +4 王了个楠 2026-03-25 4/200 2026-03-27 08:43 by 不吃魚的貓
[考研] 材料求调剂 +6 @taotao 2026-03-21 6/300 2026-03-27 08:26 by hypershenger
[考研] 349求调剂 +5 杰斯塔里斯 2026-03-21 5/250 2026-03-27 00:31 by wxiongid
[考研] 286求调剂 +5 PolarBear11 2026-03-26 5/250 2026-03-26 23:59 by 运气yunqi
[考研] 281求调剂 +3 亚克西good 2026-03-26 5/250 2026-03-26 19:48 by 不吃魚的貓
[考研] 0703化学/290求调剂/本科经历丰富/工科也可 +7 丹青奶盖 2026-03-26 7/350 2026-03-26 19:18 by macy2011
[考研] 生物学学硕，一志愿湖南大学，初试成绩338 +4 YYYYYNNNNN 2026-03-26 4/200 2026-03-26 19:00 by macy2011
[考研] 352求调剂 +4 大米饭！ 2026-03-22 4/200 2026-03-26 16:40 by 不吃魚的貓
[考研] 材料科学与工程 317求调剂 +4 JKSOIID 2026-03-26 4/200 2026-03-26 15:58 by 不吃魚的貓
[考研] 总分293求调剂 +6 加一一九 2026-03-25 8/400 2026-03-26 13:30 by yujianx
[考研] 332求调剂 +6 032500 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:45 by 418490947
[考研] 0854人工智能方向招收调剂 +4 章小鱼567 2026-03-24 4/200 2026-03-25 13:29 by 2177681040
[考研] 考研化学308分求调剂 +10 你好明天你好 2026-03-23 11/550 2026-03-25 10:23 by userper
[考研] 一志愿武理085500机械专业总分300求调剂 +3 an10101 2026-03-24 7/350 2026-03-25 00:00 by 山鬼0-
[考研] 一志愿北化315 求调剂 +3 akrrain 2026-03-24 3/150 2026-03-24 19:35 by 了了了了。。
[考研] 298求调剂 +8 上岸6666@ 2026-03-20 8/400 2026-03-23 11:02 by laoshidan
[考研] 276求调剂 +3 YNRYG 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:31 by 醉在风里
[考研] 一志愿070300浙大化学358分，求调剂！ +4 酥酥鱼.. 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:12 by Iveryant
[考研] 材料与化工085600，总分304，本科有两篇sci参与，求调剂 +4 幸运的酱酱 2026-03-22 5/250 2026-03-22 20:15 by edmund7
[考研] 一志愿华中科技大学071000，求调剂 +4 沿岸有贝壳6 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:21 by ilovexiaobin
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭