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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 关于用BSSE校正 计算键离能的问题
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chanyu1990

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 关于用BSSE校正 计算键离能的问题 已有1人参与

最近想计算一个物质，某个羟基的键离能，网上搜了很多，说是要考虑BSSE校正。不是太明白。
假如反应为   A=B•+C•
构建gif文件时应该有Counterpoise=2，然后后面电荷和多重度时，是不是要写三个（整体，片段A，片段B）
0 1；0 2；0 2。如果是的话，那么后面的原子坐标后面也要写上整数，表示片段1，片段2吧，那么请问，
这些是怎么加的呢，是用GV构造完后，保存为txt版后，手动加上的？如果这样的话，分子中的原子若是很多，
也要一个一个手动加上，岂不是容易弄错？
期待各位大神的回复！
网上某位博客的例子：
# MP2/6-31G Counterpoise=2 Opt
Counterpoise with Cartesian
0,1 <-整体、片段1、片段2的电荷和自旋多重度都一样，只需写一次即可。
1 0.00 0.00 0.92 1
9 0.17 0.00 2.73 2
1 0.77 0.00 3.43 2
9 0.00 0.00 0.00 1
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1楼 2014-08-23 16:35:38
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chanyu1990

铁杆木虫 (著名写手)
问题已解决！
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2楼2014-08-23 19:17:01
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dai_shen844

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
GV里面有划分片段的选项，对应原子序号自己划分~我是这样做的，希望对楼主有帮助~
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潜心
3楼2014-08-23 21:42:55
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chanyu1990

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by dai_shen844 at 2014-08-23 21:42:55
GV里面有划分片段的选项，对应原子序号自己划分~我是这样做的，希望对楼主有帮助~

额，我都是直接在GV里画好片段，再生成.gif格式，用.txt打开，后面1,2手动加的。原子数多了就有点麻烦，请问，你是怎么在GV里直接划分的呢？
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4楼2014-08-23 22:10:47
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dai_shen844

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
chanyu1990: 金币+10, ★★★很有帮助, 很感谢！ 2014-08-24 16:28:10
引用回帖:
4楼: Originally posted by chanyu1990 at 2014-08-23 22:10:47
额，我都是直接在GV里画好片段，再生成.gif格式，用.txt打开，后面1,2手动加的。原子数多了就有点麻烦，请问，你是怎么在GV里直接划分的呢？...

GV中单击右键view——lables，单击右键edit——atom groups——gaussian fragment，剩下的就是对应原子划分片段了，因为有颜色显示，很好确认片段的正确和错误，自己慢慢试试就会了~省很多事
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潜心
5楼2014-08-24 10:07:37
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chanyu1990

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by dai_shen844 at 2014-08-24 10:07:37
GV中单击右键view——lables，单击右键edit——atom groups——gaussian fragment，剩下的就是对应原子划分片段了，因为有颜色显示，很好确认片段的正确和错误，自己慢慢试试就会了~省很多事...

刚看了，真的很不错，谢谢了，还有一点向你请教一下，那个表后面的 unpaired spins 是什么意思，是表示单电子自旋方向吗？这个怎么判断呢？
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6楼2014-08-24 16:31:30
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dai_shen844

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by chanyu1990 at 2014-08-24 16:31:30
刚看了，真的很不错，谢谢了，还有一点向你请教一下，那个表后面的 unpaired spins 是什么意思，是表示单电子自旋方向吗？这个怎么判断呢？...

这个问题我也不是很清楚，你再请教请教其他大神吧~查查相关资料~
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潜心
7楼2014-08-24 17:03:53
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chanyu1990

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by dai_shen844 at 2014-08-24 17:03:53
这个问题我也不是很清楚，你再请教请教其他大神吧~查查相关资料~...

嗯，我再查查看，多谢了！
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8楼2014-08-24 17:33:55
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