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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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gauss98

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卡开发发

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zhou2009: 金币+3 2014-08-15 11:32:34
从统计数据上看,b3lyp算能垒不算特别好,对于b3lyp-d3不知道有没有相关测试的文献。从参考文献,wb97xd不如wb97x就是个例子,但这个还是不同于d3,但因此也不排除这种经验参数在个别体系的有效性。如果还有时间建议用m062x算一下做对比,在参考文献中的测试结果算是不错的(统计意义)。

参考dx.doi.org/10.1021/jz201525m | J. Phys. Chem. Lett. 2012, 3, 117−124。

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不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
2楼2014-08-15 11:29:36
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gauss98

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送红花一朵
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3楼2014-08-15 13:21:35
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gauss98: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-08-15 16:12:44
原则上来说B3LYP-D3比B3LYP更可靠,因为D3不仅对于长程相关,对于过渡态计算涉及到的中程相关也进行了校正,而传统DFT对于中程相关也并非考虑得很充分。这里指使用BJ形式阻尼情况时。

但也不排除个别情况下D3校正带来负面影响。如前面回帖中提到的,用M062X检验一下为好。M062X计算热力学数据,包括势垒,是明显比B3LYP要好的。虽然B3LYP的过渡态计算结果通常是没问题的,是可用的,可参考DOI: 10.1039/c0ob00477d。

至于自由能,这需要计算频率。需要注意的是,D3(BJ)在目前的高斯版本中的解析频率计算是有误的,r^-8项被忽略掉了。至于零阻尼情况没有这个问题。
4楼2014-08-15 16:08:00
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gauss98

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5楼2014-08-16 19:03:16
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
5楼: Originally posted by gauss98 at 2014-08-16 19:03:16
小弟对我的另一个较小的体系做了一个验算,能量差方向与原底楼的相反。分别用 B3LYP, B3LYP-D3, B3LYP-D3BJ, M062x, M062x-BJ ,比较 Rh催化剂在烯烃上的(马氏与反马氏)加成的过渡态能量差

M062x 计算在我的体 ...

对g09处理d3bj的情况我不了解,如sob前辈所说那样,bj只能是凑巧。明尼苏达系列的泛函拟合的成分大一些,比较依赖体系,m062x的性能算是比较出色的了,这样其实也没有更多好的选择。

这样的话就b3lyp或b3lyp-d3当中考虑看看,这种混合基组的情况建议把bsse考虑上,看看有多大差异。

计算模拟就是这样,影响的因素很多,暂不排除赝势在这个体系的可靠性。对此我不敢完全确定。
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6楼2014-08-17 14:29:56
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