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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 求大侠分析指导 B3LYP与 B3LYP-D3计算催化剂的精度可靠性
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gauss98

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1楼 2014-08-15 09:55:59
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卡开发发

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Ab Initio Amateur
★ ★ ★
zhou2009: 金币+3 2014-08-15 11:32:34
从统计数据上看，b3lyp算能垒不算特别好，对于b3lyp-d3不知道有没有相关测试的文献。从参考文献，wb97xd不如wb97x就是个例子，但这个还是不同于d3，但因此也不排除这种经验参数在个别体系的有效性。如果还有时间建议用m062x算一下做对比，在参考文献中的测试结果算是不错的（统计意义）。

参考dx.doi.org/10.1021/jz201525m | J. Phys. Chem. Lett. 2012, 3, 117−124。
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gauss98
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2楼2014-08-15 11:29:36
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gauss98

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3楼2014-08-15 13:21:35
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sobereva

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★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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gauss98: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-08-15 16:12:44
原则上来说B3LYP-D3比B3LYP更可靠，因为D3不仅对于长程相关，对于过渡态计算涉及到的中程相关也进行了校正，而传统DFT对于中程相关也并非考虑得很充分。这里指使用BJ形式阻尼情况时。

但也不排除个别情况下D3校正带来负面影响。如前面回帖中提到的，用M062X检验一下为好。M062X计算热力学数据，包括势垒，是明显比B3LYP要好的。虽然B3LYP的过渡态计算结果通常是没问题的，是可用的，可参考DOI: 10.1039/c0ob00477d。

至于自由能，这需要计算频率。需要注意的是，D3(BJ)在目前的高斯版本中的解析频率计算是有误的，r^-8项被忽略掉了。至于零阻尼情况没有这个问题。
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4楼2014-08-15 16:08:00
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gauss98

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5楼2014-08-16 19:03:16
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卡开发发

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Ab Initio Amateur
引用回帖:
5楼: Originally posted by gauss98 at 2014-08-16 19:03:16
小弟对我的另一个较小的体系做了一个验算，能量差方向与原底楼的相反。分别用 B3LYP, B3LYP-D3, B3LYP-D3BJ, M062x, M062x-BJ ，比较 Rh催化剂在烯烃上的（马氏与反马氏）加成的过渡态能量差

M062x 计算在我的体 ...

对g09处理d3bj的情况我不了解，如sob前辈所说那样，bj只能是凑巧。明尼苏达系列的泛函拟合的成分大一些，比较依赖体系，m062x的性能算是比较出色的了，这样其实也没有更多好的选择。

这样的话就b3lyp或b3lyp-d3当中考虑看看，这种混合基组的情况建议把bsse考虑上，看看有多大差异。

计算模拟就是这样，影响的因素很多，暂不排除赝势在这个体系的可靠性。对此我不敢完全确定。
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6楼2014-08-17 14:29:56
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