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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于编码区、CDS、开放阅读框的纠结
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lmc2537

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于编码区、CDS、开放阅读框的纠结 已有4人参与

查了网上的相关资料，但是没有解决本人的疑惑，这里向大家求助，谢谢！

1、编码区与CDS是同一个概念吗？因为编码区包含内含子和外显子，但是cds只包含起始密码到终止密码的序列，所以应该不是同一个概念吧？

2、CDS与开放阅读框的区别？查了网上的相关资料，但是仍旧有疑问，为什么CDS可以包括很多个开放阅读框？
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1楼 2014-07-31 17:58:35
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gyesang

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【答案】应助回帖

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lmc2537(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-08-01 10:32:22
1. 基因的编码区(Coding region），亦称为“编码序列”（Coding sequence）或“CDS”（Coding DNA Sequence），是指mRNA序列中编码蛋白质的那部分序列。
以上几个术语对应的是同一段序列，无论是在mRNA层面还是在含有内含子的DNA序列层面理解

2. CDS也等同于ORF（open reading frame）是编码蛋白质的序列，以ATG开始--终止密码子结束。
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2014-07-31 20:17:26
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gyesang

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引用回帖:
5楼: Originally posted by lmc2537 at 2014-07-31 22:17:09
按照版主的说法的话，那么CDS可包括多个ORF这句话是错误的？...

实际上，CDS和ORF是一个意思
CDS可包括多个ORF这句话是错误的
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
7楼2014-08-01 14:46:36
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gyesang

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10楼: Originally posted by usky_4 at 2014-08-01 18:13:06
不。ORF不是CDS。

CDS的定义是对的，即CDS是已知的一个基因上确确实实翻译成蛋白质的区段。

ORF则是指，任意一段序列，只要起于ATG止于终止子，都可以叫做ORF。ORF是一种预测，而不是一种已知的翻译区。即随 ...

你的回答，我非常赞同，事实也是你说的这个。
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
17楼2014-08-01 23:46:49
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