24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 895  |  回复: 0

浅曳伊言

金虫 (小有名气)

[求助] ADF能量分解

计算开壳层配合物的能量分解,前面两个片段算完后,EuL老出现 INCONSISTENT FRAGMENT OCCUPATIONS的错误,自己改了很多次还是不对,下面是我的输入文件,刚学ADF,很多都不懂。请各位大神帮帮忙!
#! /bin/sh

# ==============================
# The Molecule
# ==============================

"$ADFBIN/adf" <<eor
TITLE Eu fragment

ATOMS
1 Eu       5.127920348000       1.902897507000       1.040358508000   
END

GUIBONDS
END

SYMMETRY NOSYM

CHARGE 3 6

UNRESTRICTED

BASIS
type TZP
core Small
createoutput None
END

XC
GGA Becke Perdew
END

SAVE  TAPE21 TAPE13

FULLSCF
INTEGRATION 5.0
NOPRINT LOGFILE

eor
mv TAPE13 Eu.t13
mv TAPE21 Eu.t21
mv logfile Eu.logfile

#! /bin/sh

# ==============================
# The Molecule
# ==============================

"$ADFBIN/adf" <<eor
TITLE L fragment

ATOMS
1 P       2.383333440000       2.758331277000      -1.075838686000   
2 O       3.441035744000       1.896748531000      -0.321820735700   
3 O       3.126813339000       3.155118298000      -2.417349031000   
4 O       1.835359867000       3.904186874000      -0.275557979200   
5 O       1.211905729000       1.763264729000      -1.551421182000   
6 C      -0.080387868260       1.659922083000      -0.918897184500   
7 C      -1.159238851000       1.612983174000      -2.033032091000   
8 H      -0.097640848030       0.723540208000      -0.354404127700   
9 C      -2.527448795000       1.755726897000      -1.276776534000   
10 H      -1.009450268000       2.502700841000      -2.654060565000   
11 C      -3.720844124000       1.847216394000      -2.231466910000   
12 H      -2.481883909000       2.657600787000      -0.659146154200   
13 H      -2.652181971000       0.901724484500      -0.603409822700   
14 H      -3.582537747000       2.647217388000      -2.964587322000   
15 H      -3.862031489000       0.913114607900      -2.777656679000   
16 C       2.488923015000       3.973282852000      -3.457075275000   
17 C       3.507070804000       4.240353600000      -4.563067280000   
18 H       2.142843817000       4.903045548000      -2.997394182000   
19 H       1.633825693000       3.412249100000      -3.838870884000   
20 C       2.737182097000       4.881910746000      -5.749154263000   
21 C       3.566346357000       5.114955936000      -7.013740932000   
22 H       2.305120376000       5.834526180000      -5.418291736000   
23 H       1.893016289000       4.228152386000      -6.000635104000   
24 H       4.348577273000       5.857380960000      -6.830881541000   
25 H       4.067150699000       4.186999140000      -7.312695416000   
26 C      -5.023934919000       2.148291404000      -1.412023686000   
27 C      -6.230542512000       2.210217236000      -2.349863816000   
28 H      -4.899996487000       3.094865045000      -0.879364208800   
29 H      -5.153426082000       1.362416496000      -0.662800832800   
30 H      -6.393804239000       1.265855716000      -2.873275953000   
31 H      -6.138065931000       3.008967631000      -3.089030184000   
32 C       2.693646849000       5.609782897000      -8.194821671000   
33 C       3.516631364000       5.857407428000      -9.457230869000   
34 H       2.182574185000       6.530363185000      -7.891648857000   
35 H       1.914148559000       4.866659368000      -8.394824710000   
36 H       4.014411522000       4.946661462000      -9.801769458000   
37 H       4.280510805000       6.623436726000      -9.298651007000   
38 H       3.885160527000       3.263367451000      -4.887445628000   
39 C       4.688390667000       5.091612121000      -4.046797230000   
40 C       6.048289869000       4.753301945000      -4.665351570000   
41 H       4.765337632000       4.953338558000      -2.961789887000   
42 H       4.460632090000       6.153595962000      -4.195926092000   
43 H       6.834877366000       5.386569177000      -4.246962065000   
44 H       6.317868415000       3.710086696000      -4.473006586000   
45 H       6.058775423000       4.895959666000      -5.747559229000   
46 C      -1.028173951000       0.349516184000      -2.892011692000   
47 C      -1.410487560000       0.508063244100      -4.365089747000   
48 H      -1.593894869000      -0.468652660600      -2.429670933000   
49 H       0.022097246190       0.029597081450      -2.856703725000   
50 H      -1.251506677000      -0.426324614000      -4.906672394000   
51 H      -2.458929066000       0.788366085100      -4.494315132000   
52 H      -0.804737897200       1.280758002000      -4.847933177000   
53 P       3.833031921000       5.028756226000       2.386132691000   
54 O       2.892518589000       5.603500098000       1.285017328000   
55 O       4.608369015000       6.239870269000       3.002613559000   
56 O       3.049236864000       4.359186946000       3.571775733000   
57 C       2.096207409000       5.094095014000       4.439164643000   
58 C       1.522308612000       4.128242948000       5.466381476000   
59 H       2.651262045000       5.905901445000       4.913218222000   
60 H       1.319693157000       5.505148185000       3.791953061000   
61 C       0.373104562500       4.867366603000       6.191800642000   
62 H       1.090224308000       3.287676474000       4.907782275000   
63 C      -0.422369825700       4.031583658000       7.201892737000   
64 H      -0.324992186800       5.252918889000       5.438035386000   
65 H       0.785673867000       5.745939827000       6.704319466000   
66 H      -0.793542090800       3.120367407000       6.716141256000   
67 H       0.228597411000       3.706186919000       8.019935975000   
68 C       5.267257374000       7.321022299000       2.238238759000   
69 C       5.662609592000       8.427304806000       3.209768730000   
70 H       4.561996620000       7.671983180000       1.482193098000   
71 C       6.586919233000       9.404817087000       2.433369143000   
72 C       7.195546645000      10.528573580000       3.274401906000   
73 H       6.022126092000       9.842952376000       1.601025065000   
74 H       7.402071956000       8.822778699000       1.984826996000   
75 H       6.414905462000      11.200816400000       3.642258442000   
76 H       7.700402631000      10.111038590000       4.152874159000   
77 C      -1.610381721000       4.804977946000       7.796247703000   
78 C      -2.405986313000       3.984968736000       8.813896090000   
79 H      -2.272949456000       5.127174863000       6.984315556000   
80 H      -1.239452075000       5.720774313000       8.270939961000   
81 H      -1.779866706000       3.680482183000       9.657521704000   
82 H      -2.819299015000       3.078788002000       8.360822474000   
83 C       8.216970072000      11.368354580000       2.465738491000   
84 C       8.814293447000      12.505688380000       3.290663744000   
85 H       7.715305156000      11.769988990000       1.578250791000   
86 H       9.012931815000      10.706434440000       2.107197384000   
87 H       9.346284300000      12.132592300000       4.170318869000   
88 H       8.046709040000      13.206743730000       3.629280181000   
89 H       6.252704326000       7.955415566000       4.004507777000   
90 C       4.422544852000       9.106335280000       3.836329240000   
91 C       4.593903869000       9.525886111000       5.299087329000   
92 H       3.575082485000       8.414082705000       3.779094812000   
93 H       4.138867390000       9.971673591000       3.226546128000   
94 H       3.682062654000       9.994280592000       5.677088420000   
95 H       4.813777779000       8.660664086000       5.931736391000   
96 H       5.407234449000      10.242319410000       5.431600727000   
97 H       2.438066297000       4.950284446000       0.641607505000   
98 O       4.757321810000       3.922838660000       1.837736092000   
99 C       2.622736797000       3.589345885000       6.412897222000   
100 C       2.456078839000       2.118278091000       6.810275832000   
101 H       2.658586804000       4.214458624000       7.311583275000   
102 H       3.598283434000       3.703540454000       5.929230050000   
103 H       3.258976632000       1.803294841000       7.481176258000   
104 H       1.509821046000       1.932525364000       7.320840456000   
105 H       2.484140181000       1.469041085000       5.928381836000   
106 H      -0.225361889700       2.509069790000      -0.251419510200   
107 H       6.142422582000       6.881329989000       1.756335044000   
108 H       9.534824750000      13.072618360000       2.690142585000   
109 H      -3.241900248000       4.563366112000       9.215632254000   
110 H      -7.126105612000       2.417106426000      -1.747498885000   
111 H       2.868576617000       6.202667127000     -10.270685090000   
END

GUIBONDS
1 1 4 2.0
2 1 2 1.0
3 1 3 1.0
4 1 5 1.0
5 100 103 1.0
6 99 100 1.0
7 3 16 1.0
8 5 6 1.0
9 6 106 1.0
10 6 8 1.0
11 6 7 1.0
12 7 10 1.0
13 7 46 1.0
14 7 9 1.0
15 9 12 1.0
16 9 13 1.0
17 9 11 1.0
18 11 15 1.0
19 11 14 1.0
20 11 26 1.0
21 16 19 1.0
22 16 18 1.0
23 16 17 1.0
24 17 38 1.0
25 17 39 1.0
26 17 20 1.0
27 20 23 1.0
28 20 22 1.0
29 20 21 1.0
30 21 24 1.0
31 21 25 1.0
32 21 32 1.0
33 26 28 1.0
34 26 29 1.0
35 26 27 1.0
36 27 30 1.0
37 27 31 1.0
38 27 110 1.0
39 32 35 1.0
40 32 34 1.0
41 32 33 1.0
42 33 37 1.0
43 33 36 1.0
44 33 111 1.0
45 39 42 1.0
46 39 41 1.0
47 39 40 1.0
48 40 45 1.0
49 40 43 1.0
50 40 44 1.0
51 46 48 1.0
52 46 49 1.0
53 46 47 1.0
54 47 50 1.0
55 47 51 1.0
56 47 52 1.0
57 53 98 1.0
58 53 54 1.0
59 53 55 1.0
60 53 56 1.0
61 100 105 1.0
62 54 97 1.0
63 55 68 1.0
64 56 57 1.0
65 57 60 1.0
66 57 59 1.0
67 57 58 1.0
68 58 62 1.0
69 58 61 1.0
70 58 99 1.0
71 61 64 1.0
72 61 65 1.0
73 61 63 1.0
74 63 67 1.0
75 63 66 1.0
76 63 77 1.0
77 68 107 1.0
78 68 70 1.0
79 68 69 1.0
80 69 89 1.0
81 69 90 1.0
82 69 71 1.0
83 71 73 1.0
84 71 74 1.0
85 71 72 1.0
86 72 75 1.0
87 72 76 1.0
88 72 83 1.0
89 77 80 1.0
90 77 79 1.0
91 77 78 1.0
92 78 109 1.0
93 78 81 1.0
94 78 82 1.0
95 83 86 1.0
96 83 85 1.0
97 83 84 1.0
98 84 88 1.0
99 84 87 1.0
100 84 108 1.0
101 90 92 1.0
102 90 93 1.0
103 90 91 1.0
104 91 96 1.0
105 91 94 1.0
106 91 95 1.0
107 100 104 1.0
108 99 102 1.0
109 99 101 1.0
END

SYMMETRY NOSYM

CHARGE -1

BASIS
type TZP
core Small
createoutput None
END

XC
GGA Becke Perdew
END



SAVE  TAPE21 TAPE13

FULLSCF
INTEGRATION 5.0
NOPRINT LOGFILE

eor
mv TAPE13 L.t13
mv TAPE21 L.t21
mv logfile L.logfile

#! /bin/sh

# dependency: C:/Users/dell/Desktop/frag-EuL.Eu frag-EuL.Eu.t21
# dependency: C:/Users/dell/Desktop/frag-EuL.L frag-EuL.L.t21
# ==============================
# The Molecule
# ==============================

"$ADFBIN/adf" <<eor
ATOMS
1 P       2.383333440000       2.758331277000      -1.075838686000  f=L b=L
2 O       3.441035744000       1.896748531000      -0.321820735700  f=L b=L
3 O       3.126813339000       3.155118298000      -2.417349031000  f=L b=L
4 O       1.835359867000       3.904186874000      -0.275557979200  f=L b=L
5 O       1.211905729000       1.763264729000      -1.551421182000  f=L b=L
6 C      -0.080387868260       1.659922083000      -0.918897184500  f=L b=L
7 C      -1.159238851000       1.612983174000      -2.033032091000  f=L b=L
8 H      -0.097640848030       0.723540208000      -0.354404127700  f=L b=L
9 C      -2.527448795000       1.755726897000      -1.276776534000  f=L b=L
10 H      -1.009450268000       2.502700841000      -2.654060565000  f=L b=L
11 C      -3.720844124000       1.847216394000      -2.231466910000  f=L b=L
12 H      -2.481883909000       2.657600787000      -0.659146154200  f=L b=L
13 H      -2.652181971000       0.901724484500      -0.603409822700  f=L b=L
14 H      -3.582537747000       2.647217388000      -2.964587322000  f=L b=L
15 H      -3.862031489000       0.913114607900      -2.777656679000  f=L b=L
16 C       2.488923015000       3.973282852000      -3.457075275000  f=L b=L
17 C       3.507070804000       4.240353600000      -4.563067280000  f=L b=L
18 H       2.142843817000       4.903045548000      -2.997394182000  f=L b=L
19 H       1.633825693000       3.412249100000      -3.838870884000  f=L b=L
20 C       2.737182097000       4.881910746000      -5.749154263000  f=L b=L
21 C       3.566346357000       5.114955936000      -7.013740932000  f=L b=L
22 H       2.305120376000       5.834526180000      -5.418291736000  f=L b=L
23 H       1.893016289000       4.228152386000      -6.000635104000  f=L b=L
24 H       4.348577273000       5.857380960000      -6.830881541000  f=L b=L
25 H       4.067150699000       4.186999140000      -7.312695416000  f=L b=L
26 C      -5.023934919000       2.148291404000      -1.412023686000  f=L b=L
27 C      -6.230542512000       2.210217236000      -2.349863816000  f=L b=L
28 H      -4.899996487000       3.094865045000      -0.879364208800  f=L b=L
29 H      -5.153426082000       1.362416496000      -0.662800832800  f=L b=L
30 H      -6.393804239000       1.265855716000      -2.873275953000  f=L b=L
31 H      -6.138065931000       3.008967631000      -3.089030184000  f=L b=L
32 C       2.693646849000       5.609782897000      -8.194821671000  f=L b=L
33 C       3.516631364000       5.857407428000      -9.457230869000  f=L b=L
34 H       2.182574185000       6.530363185000      -7.891648857000  f=L b=L
35 H       1.914148559000       4.866659368000      -8.394824710000  f=L b=L
36 H       4.014411522000       4.946661462000      -9.801769458000  f=L b=L
37 H       4.280510805000       6.623436726000      -9.298651007000  f=L b=L
38 H       3.885160527000       3.263367451000      -4.887445628000  f=L b=L
39 C       4.688390667000       5.091612121000      -4.046797230000  f=L b=L
40 C       6.048289869000       4.753301945000      -4.665351570000  f=L b=L
41 H       4.765337632000       4.953338558000      -2.961789887000  f=L b=L
42 H       4.460632090000       6.153595962000      -4.195926092000  f=L b=L
43 H       6.834877366000       5.386569177000      -4.246962065000  f=L b=L
44 H       6.317868415000       3.710086696000      -4.473006586000  f=L b=L
45 H       6.058775423000       4.895959666000      -5.747559229000  f=L b=L
46 C      -1.028173951000       0.349516184000      -2.892011692000  f=L b=L
47 C      -1.410487560000       0.508063244100      -4.365089747000  f=L b=L
48 H      -1.593894869000      -0.468652660600      -2.429670933000  f=L b=L
49 H       0.022097246190       0.029597081450      -2.856703725000  f=L b=L
50 H      -1.251506677000      -0.426324614000      -4.906672394000  f=L b=L
51 H      -2.458929066000       0.788366085100      -4.494315132000  f=L b=L
52 H      -0.804737897200       1.280758002000      -4.847933177000  f=L b=L
53 P       3.833031921000       5.028756226000       2.386132691000  f=L b=L
54 O       2.892518589000       5.603500098000       1.285017328000  f=L b=L
55 O       4.608369015000       6.239870269000       3.002613559000  f=L b=L
56 O       3.049236864000       4.359186946000       3.571775733000  f=L b=L
57 C       2.096207409000       5.094095014000       4.439164643000  f=L b=L
58 C       1.522308612000       4.128242948000       5.466381476000  f=L b=L
59 H       2.651262045000       5.905901445000       4.913218222000  f=L b=L
60 H       1.319693157000       5.505148185000       3.791953061000  f=L b=L
61 C       0.373104562500       4.867366603000       6.191800642000  f=L b=L
62 H       1.090224308000       3.287676474000       4.907782275000  f=L b=L
63 C      -0.422369825700       4.031583658000       7.201892737000  f=L b=L
64 H      -0.324992186800       5.252918889000       5.438035386000  f=L b=L
65 H       0.785673867000       5.745939827000       6.704319466000  f=L b=L
66 H      -0.793542090800       3.120367407000       6.716141256000  f=L b=L
67 H       0.228597411000       3.706186919000       8.019935975000  f=L b=L
68 C       5.267257374000       7.321022299000       2.238238759000  f=L b=L
69 C       5.662609592000       8.427304806000       3.209768730000  f=L b=L
70 H       4.561996620000       7.671983180000       1.482193098000  f=L b=L
71 C       6.586919233000       9.404817087000       2.433369143000  f=L b=L
72 C       7.195546645000      10.528573580000       3.274401906000  f=L b=L
73 H       6.022126092000       9.842952376000       1.601025065000  f=L b=L
74 H       7.402071956000       8.822778699000       1.984826996000  f=L b=L
75 H       6.414905462000      11.200816400000       3.642258442000  f=L b=L
76 H       7.700402631000      10.111038590000       4.152874159000  f=L b=L
77 C      -1.610381721000       4.804977946000       7.796247703000  f=L b=L
78 C      -2.405986313000       3.984968736000       8.813896090000  f=L b=L
79 H      -2.272949456000       5.127174863000       6.984315556000  f=L b=L
80 H      -1.239452075000       5.720774313000       8.270939961000  f=L b=L
81 H      -1.779866706000       3.680482183000       9.657521704000  f=L b=L
82 H      -2.819299015000       3.078788002000       8.360822474000  f=L b=L
83 C       8.216970072000      11.368354580000       2.465738491000  f=L b=L
84 C       8.814293447000      12.505688380000       3.290663744000  f=L b=L
85 H       7.715305156000      11.769988990000       1.578250791000  f=L b=L
86 H       9.012931815000      10.706434440000       2.107197384000  f=L b=L
87 H       9.346284300000      12.132592300000       4.170318869000  f=L b=L
88 H       8.046709040000      13.206743730000       3.629280181000  f=L b=L
89 H       6.252704326000       7.955415566000       4.004507777000  f=L b=L
90 C       4.422544852000       9.106335280000       3.836329240000  f=L b=L
91 C       4.593903869000       9.525886111000       5.299087329000  f=L b=L
92 H       3.575082485000       8.414082705000       3.779094812000  f=L b=L
93 H       4.138867390000       9.971673591000       3.226546128000  f=L b=L
94 H       3.682062654000       9.994280592000       5.677088420000  f=L b=L
95 H       4.813777779000       8.660664086000       5.931736391000  f=L b=L
96 H       5.407234449000      10.242319410000       5.431600727000  f=L b=L
97 H       2.438066297000       4.950284446000       0.641607505000  f=L b=L
98 O       4.757321810000       3.922838660000       1.837736092000  f=L b=L
99 C       2.622736797000       3.589345885000       6.412897222000  f=L b=L
100 C       2.456078839000       2.118278091000       6.810275832000  f=L b=L
101 H       2.658586804000       4.214458624000       7.311583275000  f=L b=L
102 H       3.598283434000       3.703540454000       5.929230050000  f=L b=L
103 H       3.258976632000       1.803294841000       7.481176258000  f=L b=L
104 H       1.509821046000       1.932525364000       7.320840456000  f=L b=L
105 H       2.484140181000       1.469041085000       5.928381836000  f=L b=L
106 H      -0.225361889700       2.509069790000      -0.251419510200  f=L b=L
107 H       6.142422582000       6.881329989000       1.756335044000  f=L b=L
108 Eu       5.127920348000       1.902897507000       1.040358508000  f=Eu b=Eu
109 H      -3.241900248000       4.563366112000       9.215632254000  f=L b=L
110 H      -7.126105612000       2.417106426000      -1.747498885000  f=L b=L
111 H       2.868576617000       6.202667127000     -10.270685090000  f=L b=L
112 H       9.534824750000      13.072618360000       2.690142585000  f=L b=L
END

GUIBONDS
1 1 4 2.0
2 1 2 1.0
3 1 3 1.0
4 1 5 1.0
5 100 103 1.0
6 2 108 1.0
7 3 16 1.0
8 5 6 1.0
9 6 106 1.0
10 6 8 1.0
11 6 7 1.0
12 7 10 1.0
13 7 46 1.0
14 7 9 1.0
15 9 12 1.0
16 9 13 1.0
17 9 11 1.0
18 11 15 1.0
19 11 14 1.0
20 11 26 1.0
21 16 19 1.0
22 16 18 1.0
23 16 17 1.0
24 17 38 1.0
25 17 39 1.0
26 17 20 1.0
27 20 23 1.0
28 20 22 1.0
29 20 21 1.0
30 21 24 1.0
31 21 25 1.0
32 21 32 1.0
33 26 28 1.0
34 26 29 1.0
35 26 27 1.0
36 27 30 1.0
37 27 31 1.0
38 27 110 1.0
39 32 35 1.0
40 32 34 1.0
41 32 33 1.0
42 33 37 1.0
43 33 36 1.0
44 33 111 1.0
45 39 42 1.0
46 39 41 1.0
47 39 40 1.0
48 40 45 1.0
49 40 43 1.0
50 40 44 1.0
51 46 48 1.0
52 46 49 1.0
53 46 47 1.0
54 47 50 1.0
55 47 51 1.0
56 47 52 1.0
57 53 98 1.0
58 53 54 1.0
59 53 55 1.0
60 53 56 1.0
61 100 105 1.0
62 54 97 1.0
63 55 68 1.0
64 56 57 1.0
65 57 60 1.0
66 57 59 1.0
67 57 58 1.0
68 58 62 1.0
69 58 61 1.0
70 58 99 1.0
71 61 64 1.0
72 61 65 1.0
73 61 63 1.0
74 63 67 1.0
75 63 66 1.0
76 63 77 1.0
77 68 107 1.0
78 68 70 1.0
79 68 69 1.0
80 69 89 1.0
81 69 90 1.0
82 69 71 1.0
83 71 73 1.0
84 71 74 1.0
85 71 72 1.0
86 72 75 1.0
87 72 76 1.0
88 72 83 1.0
89 77 80 1.0
90 77 79 1.0
91 77 78 1.0
92 78 109 1.0
93 78 81 1.0
94 78 82 1.0
95 83 86 1.0
96 83 85 1.0
97 83 84 1.0
98 84 88 1.0
99 84 87 1.0
100 84 112 1.0
101 90 92 1.0
102 90 93 1.0
103 90 91 1.0
104 91 96 1.0
105 91 94 1.0
106 91 95 1.0
107 98 108 1.0
108 99 102 1.0
109 99 101 1.0
110 99 100 1.0
111 100 104 1.0
END

SYMMETRY NOSYM

CHARGE 2 6

UNRESTRICTED

BASIS
type TZP
core Small
createoutput None
END

XC
GGA Becke Perdew
END

Fragments
    Eu Eu.t21
    L  L.t21
end
SAVE  TAPE21 TAPE13

Fragoccupations
Eu
  A 10//4
Subend
L
  A 178//178
Subend
End

FULLSCF
INTEGRATION 5.0
NOPRINT LOGFILE

eor

mv TAPE13 EuL.t13
mv TAPE21 EuL.t21
mv logfile EuL.logfile
回复此楼
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

智能机器人

Robot (super robot)

我们都爱小木虫

找到一些相关的精华帖子,希望有用哦~

科研从小木虫开始,人人为我,我为人人
相关版块跳转 我要订阅楼主 浅曳伊言 的主题更新
信息提示
请填处理意见