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xiaoxiao136

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】adf如何算光电子谱 已有5人参与

下面这个是adf直接得到的图,怎么纵坐标是oscillater strength
该怎么处理,还是我算错了,我是这样算的main options->excitations,CD->singlet&triplets->run


ps:还有个问题是我用$ADFBIN/adf {-n nproc} out,交作业后,不能将窗口关了,用什么命令能交上作业就关了呢。
麻烦高手了

[ Last edited by xiaoxiao136 on 2010-7-8 at 22:07 ]
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xiaoxiao136

木虫 (正式写手)

aylayl08:别着急,无人回的话可以pm版主提升帖子,或者自己顶几下 2010-07-12 19:09:57
还没人回复,版主就批阅完了
2楼2010-07-09 08:52:43
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上

★ ★ ★
aylayl08(金币+3):谢谢专家回复 2010-07-09 14:53:08
$ADFBIN/adf {-n nproc} out加上后台执符 &
还有通任务一般不需要这样:准备输入文件input.e,chmod +x input.e 使其具有可执行权限
ADF的输入文件一般是个脚本,所以./input.e > output.out &就可以了。
至于多CPU执行,你可以在输入文件中的相关行中加入 -n 4 (4CPU并行):
$ADFBIN/dirac -n 4 < $ADFRESOURCES/Dirac/H

$ADFBIN/adf -n 4 << eor
Create Au   $ADFRESOURCES/ZORA/TZ2P/Au

Relativistic scalar zora
CorePotentials  t12.rel &
Au 1
End

End Input
eor
前途光明,出路难觅!
3楼2010-07-09 09:39:00
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上


aylayl08(金币+1):辛苦了 2010-07-09 14:53:17
xiaoxiao136(金币+5): 2010-07-10 13:48:33
这个是电子谱吧。据Bredas,光电子谱是通过DOS图进行拟合的。
前途光明,出路难觅!
4楼2010-07-09 09:39:35
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xiaoxiao136

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by lihb734 at 2010-07-09 09:39:00:
$ADFBIN/adf {-n nproc} out加上后台执符 &
还有通任务一般不需要这样:准备输入文件input.e,chmod +x input.e 使其具有可执行权限
ADF的输入文件一般是个脚本,所以./input.e > output.out ...

我在gaussian里面会,在adf里面还真不会
需要两个稳定构型的总能量相减,我看了手册,好像不计算总能量
5楼2010-07-11 20:27:42
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Miracle922

铜虫 (正式写手)

★ ★
xiaoxiao136(金币+1):谢谢参与
aylayl08(金币+1):谢谢讨论 2010-07-14 09:26:30
xiaoxiao136(金币+1): 2010-07-15 09:57:19
引用回帖:
Originally posted by xiaoxiao136 at 2010-07-08 21:13:28:
下面这个是adf直接得到的图,怎么纵坐标是oscillater strength
该怎么处理,还是我算错了,我是这样算的main options->excitations,CD->singlet&triplets->run
[img]http://pic.muchong.com/201007 ...

ADF直接计算垂直跃迁能,所示谱图是通过对Gaussian线型进行拟合,可以找到Gaussian函数的具体表达式,确定选择合适的半宽和中心对应的垂直跃迁能,然后再origin里拟合即可。模拟的谱图一般对纵坐标强度没有比较意义,与实验对照的是横坐标具有实际意义。
做到极致,做到细处
6楼2010-07-12 21:27:14
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ccyb

银虫 (小有名气)

★ ★
xiaoxiao136(金币+1):谢谢参与
aylayl08(金币+1):谢谢讨论 2010-07-14 09:26:43
xiaoxiao136(金币+5): 2010-07-15 09:57:44
引用回帖:
Originally posted by xiaoxiao136 at 2010-07-08 21:13:28:
下面这个是adf直接得到的图,怎么纵坐标是oscillater strength
该怎么处理,还是我算错了,我是这样算的main options->excitations,CD->singlet&triplets->run
[img]http://pic.muchong.com/201007 ...

很明显这不是光电子谱 ,而是光吸收谱,纵轴是振子强度,横轴是光子能量。
也就是 电子激发态+谱线展宽的图。

光电子谱其实是分子光电效应的强度与光子能量关系,涉及到电离。
7楼2010-07-12 23:33:12
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e-chenm

铁杆木虫 (职业作家)

美的让你揪心,恨我吧


xiaoxiao136(金币+1):谢谢参与
偶也想知道

谁能给个权威说法啊
整天开会多开心啊-----happy天使
8楼2010-07-13 00:34:31
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xiaoxiao136

木虫 (正式写手)

[quote]Originally posted by xiaoxiao136 at 2010-07-11 20:27:42:

[ Last edited by xiaoxiao136 on 2010-7-15 at 10:14 ]
9楼2010-07-15 10:11:20
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xiaoxiao136

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by Miracle922 at 2010-07-12 21:27:14:


ADF直接计算垂直跃迁能,所示谱图是通过对Gaussian线型进行拟合,可以找到Gaussian函数的具体表达式,确定选择合适的半宽和中心对应的垂直跃迁能,然后再origin里拟合即可。模拟的谱图一般对纵坐标强度没有比 ...

那怎么用ADF直接计算垂直跃迁能,直接加EXCITATIONS吗?
关于ade的值,需要不同价态的总能量,05年以前的版本好像没有total energy关键字,那是怎么算的呢?
还有Gaussian函数的具体表达式是指什么,我当时只是用实验室的一个小软件做的,糊里糊涂的,麻烦高手讲解一下
10楼2010-07-15 10:16:18
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