| 查看: 2924 | 回复: 6 | |||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||||
[求助]
拟南芥核基因编码蛋白，定位于叶绿体。已知氨基酸序列，怎么找到前导肽？ 已有1人参与
|
|||||
|
拟南芥数据库，已知基因编号，里面有很多注释，但是看不懂。 我想体外表达目的蛋白（核基因编码，定位于叶绿体），应该用cDNA序列作为模板？但是不知道哪里是起始密码子，哪里是终止密码子？ 氨基酸序列是否包含定位到叶绿体的前导肽？ 为什么氨基酸序列的长度与cDNA的核酸序列长度对不上？ 本人是做原核生物的，有很多问题不太清楚，请各位大侠帮助！！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 蛋白质生物学实验经验 | 核酸生物学实验经验 | 生物信息学 |
» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有89人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 核酸序列比对方法
已经有8人回复
- 鉴定一个基因的特定功能需要从哪些方面开展研究才能确定？
已经有10人回复
- 【求助/交流】请教多个蛋白质序列比对显示保守区域的问题
已经有9人回复
- 生物信息学专题－生物版，医学版和信息科学版共同创建
已经有87人回复
3楼2014-07-17 16:23:07
liuderong
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 310 (大学生)
- 金币: 8202.1
- 红花: 31
- 帖子: 582
- 在线: 142.1小时
- 虫号: 1882145
- 注册: 2012-07-07
- 性别: GG
- 专业: 生物化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
shuihaizi(西门吹雪170代发): 金币+5, 鼓励回帖交流 2014-07-17 12:24:53
shuihaizi: 金币+20, ★★★很有帮助 2014-07-17 16:20:27
感谢参与，应助指数 +1
shuihaizi(西门吹雪170代发): 金币+5, 鼓励回帖交流 2014-07-17 12:24:53
shuihaizi: 金币+20, ★★★很有帮助 2014-07-17 16:20:27
|
1.体外表达是没有剪接机制的，要用CDS。 2.我估计你到拟南芥数据库里下载的cDNA是和RNA对应的序列，这种序列虽然没有内含子，但是有3‘和5’-UTR，所以长度和氨基酸长度对应不上，你要从这段序列中找到CDS（氨基酸编码序列）。 3.你可以到NCBI里，拿你的蛋白序列和cDNA序列做比对，用blastx，一下就出结果了。或者从3个位置翻译你的cDNA，总有一个是对的，然后找出起始位点。再或者把基因编号贴出来，论坛里很多人都会找的。 4.网站提供的序列一般都是全长，从起始密码到终止密码子，里头包含了前导肽。 |
2楼2014-07-17 09:24:14
liuderong
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 310 (大学生)
- 金币: 8202.1
- 红花: 31
- 帖子: 582
- 在线: 142.1小时
- 虫号: 1882145
- 注册: 2012-07-07
- 性别: GG
- 专业: 生物化学
★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-07-26 22:15:00
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2014-07-26 22:15:00
|
CDS编码成蛋白后是带有前导肽的。如果要知道前导肽，最直接并且最有效的办法就是看看其他人的研究，说不定有人做了相关的研究（照我的经验一般都不会有人做这类研究的，要运气很好才能碰到）。大部分人都是利用网站上的一些工具预测前导肽，http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/和http://smart.embl-heidelberg.de/smart/set_mode.cgi?NORMAL=1都可以试试 |
4楼2014-07-17 20:47:31
5楼2014-07-17 21:31:38
