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植物人的米

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于高斯寻找过渡态,跪求各位大神指点啊已有3人参与

那个,关于环己酮和芳香醛的Aldol反应,要求寻找他的过渡态,该怎么去弄呢?对于高斯,我基本不会啊,说是先要寻找基态,写出反应机理,那他的反应机理又是什么呢?真真的完全没头绪啊,跪求大神给予指点啊,指指路之类的就好了,多谢多谢
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 戴世杰 at 2014-07-14 13:58:37
就这个问题,有过争论。我觉得不做优化好,并且能加快计算速度。就像在在峰谷,哪里才是向上攀登的方向。
...

这样的话我觉得可以先优化,之后根据反应的方向去微调结构,然后用于寻找过渡态,这样也不会跑太偏,像LZ这个反应知道机理的话反应历程还是可以猜出一二的
9楼2014-07-14 14:07:19
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戴世杰

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
高斯只能做基元反应过渡态寻找,建议用qst2方法。可以查查机理书,自己设计反应物和产物,推荐关键字opt=(qst2, calcfc)

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-07-14 07:07:55
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植物人的米

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 戴世杰 at 2014-07-14 07:07:55
高斯只能做基元反应过渡态寻找,建议用qst2方法。可以查查机理书,自己设计反应物和产物,推荐关键字opt=(qst2, calcfc)

qst2这个方法我知道,只是不知道该如何开始,是不是先画出环己酮和芳香醛,然后给每个原子编号,然后就可以算了么?可是该如何寻找基态呢?请问方便留个QQ之类的么?实在是不太会啊,谢谢
3楼2014-07-14 10:18:39
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
寻找过渡态必须用反应物和产物的稳定基态结构来做。
你可以从以下几步开始:
如何画分子? google “gaussview 教程”
如何算基态和过渡态? google “gaussian opt”,点进去,把它看完。
完全不懂高斯?google “高斯计算基础教程”
反应机理? google "羟醛反应"

或者:
觉得太复杂?挂个作者找别人帮你算
4楼2014-07-14 11:53:57
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