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lusostty金虫 (小有名气)
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【动力学-扩散】关于模拟X时间 舍弃前Y时间的理解 已有2人参与
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关于扩散系数的模拟 很多文献都是这样描述的：例如，模拟进行了1000ps，前200ps-1000ps的动力学构型计算扩散系数 我之前的做法是：直接进行1000ps的动力学模拟，得到一串数据，取其中200ps-1000ps进行线性拟合，计算扩散系数。虽然相关性还不错，但这条直线应该是不过原点的。 今天忽然想起来这种方法应该值得商榷，会不会是这样的：先进行200ps的模拟，然后在此基础上（current）进行800ps的模拟，这样得到的MSD~T线性拟合应该是过原点的 以上 两种方法哪一种正确，或者都存在问题？ 谢谢 |
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5楼2014-07-11 09:49:11
lusostty
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