24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1351  |  回复: 16

lusostty

金虫 (小有名气)

[求助] 【动力学-扩散】关于模拟X时间 舍弃前Y时间的理解 已有2人参与

关于扩散系数的模拟

很多文献都是这样描述的:例如,模拟进行了1000ps,前200ps-1000ps的动力学构型计算扩散系数

我之前的做法是:直接进行1000ps的动力学模拟,得到一串数据,取其中200ps-1000ps进行线性拟合,计算扩散系数。虽然相关性还不错,但这条直线应该是不过原点的。

今天忽然想起来这种方法应该值得商榷,会不会是这样的:先进行200ps的模拟,然后在此基础上(current)进行800ps的模拟,这样得到的MSD~T线性拟合应该是过原点的

以上 两种方法哪一种正确,或者都存在问题?

谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by lusostty at 2014-07-12 12:26:29
那如果计算扩散系数呢?如果取中间段MSD数据  它也是不过原点的 那怎么办...

根据爱因斯坦方程,求出直线的斜率即可。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
11楼2014-07-12 12:28:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

lusostty

金虫 (小有名气)

自己顶帖 :
2楼2014-07-10 16:29:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

polypro

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
对于Dc计算,前200ps是用于消除初始的人为因素干扰的。理论上讲,Dc是动态平衡值,与初始点的选取无关。
泉涸,鱼相与处于陆,相呴以湿,相濡以沫,不如相忘于江湖。
3楼2014-07-11 08:03:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
个人认为,两种方法计算均方位移的时候,都应该取中间时间段的数据。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
4楼2014-07-11 08:41:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lusostty

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-07-11 08:41:11
个人认为,两种方法计算均方位移的时候,都应该取中间时间段的数据。

那拟合的直线方程 就不会过原点了  总觉得这样做似乎有点问题
5楼2014-07-11 09:49:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lusostty

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by polypro at 2014-07-11 08:03:17
对于Dc计算,前200ps是用于消除初始的人为因素干扰的。理论上讲,Dc是动态平衡值,与初始点的选取无关。

谢谢你的回复 我考察吸附量对扩散系数的影响 拟合的都是一条条不过原点的直线 这样具有可比性么?
6楼2014-07-11 09:51:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lusostty

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-07-11 08:41:11
个人认为,两种方法计算均方位移的时候,都应该取中间时间段的数据。

谢谢你的回复 我考察吸附量对扩散系数的影响 拟合的都是一条条不过原点的直线 这样具有可比性么?
7楼2014-07-11 09:52:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

引用回帖:
7楼: Originally posted by lusostty at 2014-07-11 09:52:04
谢谢你的回复 我考察吸附量对扩散系数的影响 拟合的都是一条条不过原点的直线 这样具有可比性么?...

文献上常直接比较MSD曲线

[ 发自小木虫客户端 ]
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
8楼2014-07-11 12:19:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lusostty

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 月只蓝 at 2014-07-11 12:19:18
文献上常直接比较MSD曲线
...

那如果计算扩散系数呢?如果取中间段MSD数据  它也是不过原点的 那怎么办
9楼2014-07-12 12:26:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

引用回帖:
9楼: Originally posted by lusostty at 2014-07-12 12:26:29
那如果计算扩散系数呢?如果取中间段MSD数据  它也是不过原点的 那怎么办...

为什么要求过原点呢?
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
10楼2014-07-12 12:27:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lusostty 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 新一代电子信息294求调剂 不挑学校 +7 Ytyt11 2026-04-09 8/400 2026-04-12 16:57 by ajpv风雷
[考研] 299求调剂 +8 ZVVZ13 2026-04-08 8/400 2026-04-12 00:40 by 蓝云思雨
[考研] 296求调剂 +8 汪!?! 2026-04-09 8/400 2026-04-11 21:02 by 逆水乘风
[考研] 343求调剂 +9 王国帅 2026-04-10 9/450 2026-04-11 20:31 by dongdian1
[考研] 0854调剂 +8 950824he@ 2026-04-09 8/400 2026-04-11 10:11 by zhq0425
[考研] 本科211 工科085400 280分求调剂 可跨专业 +11 LZH(等待调剂中 2026-04-10 11/550 2026-04-11 08:39 by zhq0425
[考研] 302分求调剂 +9 凡语祈愿 2026-04-08 10/500 2026-04-10 23:26 by 314126402
[考研] 一志愿中南大学物理学,英一66,求调剂 +4 长烟旖旎 2026-04-08 5/250 2026-04-10 10:31 by 颖果儿
[考研] 江苏大学 工科调剂 捡漏 +3 Evan_Liu 2026-04-09 5/250 2026-04-10 10:22 by Evan_Liu
[考研] 材料化工总分334求调剂 +16 Riot2025 2026-04-08 17/850 2026-04-09 20:19 by maddjdld
[考研] 274求调剂 +5 山阿蔓 2026-04-07 5/250 2026-04-09 15:28 by 18828373951
[考研] 349学科化学045106求调剂,化学类都可以 +8 保好懂懂 2026-04-08 8/400 2026-04-09 14:03 by xulei3024
[考研] 一志愿西南大学生物学学硕344 求生物学相关调剂/生物与医药 +7 超人不会飞@ 2026-04-08 7/350 2026-04-09 09:35 by gong120082
[考研] 286求调剂 +19 Faune 2026-04-08 20/1000 2026-04-09 08:36 by 哦哦123
[考研] 281求调剂 +10 椰子蘑菇 2026-04-06 10/500 2026-04-08 11:43 by zzucheup
[考研] 机械工程264学硕求调剂 +3 qiushangxian 2026-04-06 3/150 2026-04-08 01:53 by Linzejun
[考研] 调剂求助(生物与医药) +6 @6952 2026-04-06 6/300 2026-04-07 23:52 by lys0704
[考研] 085602调剂 初试总分335 +3 19123253302 2026-04-06 3/150 2026-04-07 18:00 by jp9609
[考研] 材料调剂 +17 小刘同学吖吖 2026-04-06 18/900 2026-04-07 11:41 by 诗与自由
[考研] 307求调剂 +3 Youth@@ 2026-04-07 3/150 2026-04-07 09:25 by 小黑不怕难
信息提示
请填处理意见