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yangcaoqing新虫 (小有名气)
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MapQTL中loc文件的格式
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请问在多个linkage group的MapQTL分析中，loc文件的格式应该是什么样子的呢？ 课题组的同事在前期的linkage Map构建过程中，linkage group是分开构建的，每一个group都有一个独立的loc文件。然而在MapQTL中，需要把所有的linkage group放在一起分析，需要计算全基因组水平的LOD阈值。 现在我面前的问题是我可以把所有的linkage group放在一个map文件中，但是不清楚各个独立的loc文件应该怎么处理，怎么分析呢？看了软件自带的样本文件，愣是木有看懂啊！！！每次用一个group的loc文件分析明显不对，结果的峰图中只有用到loc文件的那个group有峰图，别的都因为singularity error没有任何峰图。坐等各位MapQTL高手解救，谢谢！ |
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yangcaoqing
新虫 (小有名气)
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