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k1040348263

金虫 (正式写手)

[求助] 想用色谱定量癌细胞中的DNA,但有好多问题不懂,请各位前辈帮帮忙吧,实验做不动了

我想破碎癌细胞,然后定量细胞中的DNA浓度。现在觉得操作有问题,不知得到的DNA是否有损失。首先,我在3000转速(应该不属于小型离心机吧,,个头还挺大,我也不知离心力多少)下,将细胞离心了10分钟,拿出后,离心管的下部有少许白色沉淀,我认为是细胞都离心下来了(不知这时细胞破了吗),然后将培养液吸出,加入了2ml的灭菌水,这时发现水中出现了白色的东西,是细胞膜吗?然后我又在100w的功率下超声了5~6分钟,这时DNA是不是断掉了,那蛋白质与DNA分开了吗?我想将DNA酶解成核苷酸,然后进色谱定量,不知蛋白质或细胞中的其他东西影响吗?不知有没有做过定量细胞中的DNA的,用的什么方法?
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

对于肿瘤细胞而言,其基因组DNA有多态性,不是原来的人类基因组的染色体对应的DNA,即使能够完全水解为脱氧核苷酸,又如何直接从色谱峰确定N个的已经突变的基因组DNA的脱氧核苷酸的含量哪?
17楼2014-07-04 23:06:16
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
k1040348263: 金币+5, ★★★很有帮助, 非常感谢你,亲。 2014-07-03 21:17:56
今天我是来不及回答你怎么多问题,改日给你一个标准protocol,我现在刚开完会,手里没有,一会去聚餐。

超声肯定是能够粉碎细胞、DNA甚至断裂肽键。

至于蛋白质、DNA和其他细胞成分彼此分开和特异性鉴定都有成熟的试验方法,你可以参考有关细胞生物学和分子生物学实验手册。彻底裂解细胞也可以用SDS。蛋白质、DNA都可以用特异性波长的光谱鉴定纯度和浓度。
蛋白质-DNA形成分子复合体当然会影响DNA酶解,这就是蛋白质-DNA相互作用的研究方法保护法或者组激发的基本原理。

“我想将DNA酶解成核苷酸,然后进色谱定量”--------我不懂你这一部实验的目的,如果想定量确定DNA,提纯DNA之后,用紫外光很易确定其浓度。

问题太多,我改日解答贴资料。
2楼2014-07-03 18:47:50
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k1040348263

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 凌波丽 at 2014-07-03 18:47:50
今天我是来不及回答你怎么多问题,改日给你一个标准protocol,我现在刚开完会,手里没有,一会去聚餐。

超声肯定是能够粉碎细胞、DNA甚至断裂肽键。

至于蛋白质、DNA和其他细胞成分彼此分开和特异性鉴定都有 ...

别忘了给我一个标准protocol,马上就要放假了,我想快点做实验啊
3楼2014-07-03 21:19:34
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k1040348263

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 凌波丽 at 2014-07-03 18:47:50
今天我是来不及回答你怎么多问题,改日给你一个标准protocol,我现在刚开完会,手里没有,一会去聚餐。

超声肯定是能够粉碎细胞、DNA甚至断裂肽键。

至于蛋白质、DNA和其他细胞成分彼此分开和特异性鉴定都有 ...

记得尽快给我一个标准protocol好吗,马上就要放假了,我想快点做实验,快些回家。
4楼2014-07-03 21:22:48
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