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暴力曹

银虫 (初入文坛)

[求助] 在做环介导等温扩增lamp,有些想法和问题想和大家交流请教一下,请前辈们多多指教~

这段时间在做这方面的实验,有些问题有些不明白,请各位多指教~
问题一,引物是直接在线网页版设计的,开始用PCR仪做的温度梯度,在61~65这个范围扩增效果都很好,反应1h;前期在干浴锅上65反应1h就能明显看到沉淀,电泳条带也不错,但后来这段时间要么经常扩不出来,或者是需要延长扩增时间才可以,体系条件是完全一样的,而且从61到65都试过,有点疑惑。这种情况是什么原因,酶是新的,内引物也是隔一段时间就更新,会不会是因为外引物时间长了造成的?
问题二,关于反应结果的判定,用SYBR Green I做染色剂,在反应结束后加入观察荧光,这个做的还比较顺利,就是想可不可以在实验一开始就加入染料,然后直接反应结束观察荧光情况就好,这样可以避免污染,不知道可不可行,改天做个实验看看;
问题三,关于钙黄绿素做染色剂,和氯化锰都是直接从生工拿的国产的,便宜得很,但效果还可以,问题其实和一有点相同,就是现在反应时间要90min才能明显反应产生荧光,会不会是这两个试剂对酶活有影响,造成反应减慢?这里面还有个小教训分享一下,一般DNA是用水溶的,当时为了更长时间保存,用TE溶解的,结果反应体系每次在加入模板后就立马有荧光了,很囧,折腾了好久才想到原因。。。
问题四,在nature的文章里看到体系又加甜菜碱和tween20,我现在的体系都没加这两种,其作用大么?
问题五,环引物是不是会提高扩增速度,具体该怎么设计?
有点多,诸位大神多指教~
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无心亦心 自在观真
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暴力曹

银虫 (初入文坛)

好的,谢谢~
无心亦心 自在观真
2楼2014-07-04 12:22:08
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hooyawang

铜虫 (小有名气)

同学你好,我也在做关于LAMP方面的实验,我想问一下您的钙黄绿素和甜菜碱从哪个公司买的,可以把链接发给我吗?
LAMP
3楼2014-08-21 16:32:48
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郑传益

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hooyawang at 2014-08-21 16:32:48
同学你好,我也在做关于LAMP方面的实验,我想问一下您的钙黄绿素和甜菜碱从哪个公司买的,可以把链接发给我吗?

同求,1410928287
满足等于堕落
4楼2015-04-25 02:26:45
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玲玲在人间

铁虫 (小有名气)

加好所有的体系后,吧显色剂点在PCR管盖上,反应后李欣或者甩几下就行的,我的实验是过一段时间(1各月左右)就出现假阳性,怀疑是不是外引物太长造成的,另外,我的4条引物是混合在一起保存的,这样引物之间会不会自连或者造成引物的不稳定,液相得到相关抓也人员的解答,谢谢
5楼2015-05-09 14:07:09
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施施施施施

新虫 (初入文坛)

请问楼主用钙黄绿素做出结果了么?我最近也在做这一方面,可是一直没结果。楼主做出来的话,能把体系分享下么?谢谢
6楼2016-03-25 17:13:30
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wzc次

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 施施施施施 at 2016-03-25 17:13:30
请问楼主用钙黄绿素做出结果了么?我最近也在做这一方面,可是一直没结果。楼主做出来的话,能把体系分享下么?谢谢

你好,请问你用钙黄绿素做的结果怎么样?我最近也准备用这个做。请教一下
7楼2017-02-16 17:10:47
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LAMP007

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
1楼: Originally posted by 暴力曹 at 2014-07-01 15:49:44
这段时间在做这方面的实验,有些问题有些不明白,请各位多指教~
问题一,引物是直接在线网页版设计的,开始用PCR仪做的温度梯度,在61~65这个范围扩增效果都很好,反应1h;前期在干浴锅上65反应1h就能明显看到沉淀 ...

想请教一下为什么我加入了SYBR green I稀释到100×的加入后,在紫外灯下有引物都会显色,你是怎么加入,阴性没有颜色的。

发自小木虫Android客户端
8楼2017-09-10 23:16:01
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15112009180

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by LAMP007 at 2017-09-10 23:16:01
想请教一下为什么我加入了SYBR green I稀释到100×的加入后,在紫外灯下有引物都会显色,你是怎么加入,阴性没有颜色的。
...

你的SYBRgreen浓度太低了

发自小木虫Android客户端
9楼2017-10-14 15:16:11
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15112009180

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 15112009180 at 2017-10-14 15:16:11
你的SYBRgreen浓度太低了
...

SYBRGREENl可能被污染了

发自小木虫Android客户端
10楼2017-10-14 15:18:15
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