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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » LAMP（环介导等温扩增技术）
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wangxiaoyu8

金虫 (小有名气)

[求助] LAMP（环介导等温扩增技术） 已有1人参与

请问在使用primerexplore设计LAMP引物时，在线软件V3和V4有什么区别呢，当设计出许多引物时，第一步怎么选择，是看dG（dimmer）值吗，怎么看，说明书里的“Primer sets are chosen that encompasses the entire length if possible”是啥意思啊？请各位高手指教~
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1楼 2011-11-19 09:49:15
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hzl5888

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

wangxiaoyu8(金币+1): 谢谢支持~ 2011-11-22 12:38:31
我记得我当时做LAMP这个实验的时候，引物设计用的是在线的一个软件，很简单好用，但是网址家里的电脑没收藏，周一去单位找一下。楼主可以试用一下。
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2楼2011-11-20 08:26:54
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普通回帖

wangxiaoyu8

金虫 (小有名气)
在线软件就是primerexplore吧？网址是http://primerexplorer.jp/e/，里面有两种，V3和V4，但二者区别我一直没搞懂，引物设计选择也没弄懂，恭候赐教~
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3楼2011-11-20 09:05:29
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hzl5888

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

wangxiaoyu8(金币+3): 太感谢了，请问您所说的前三对引物是按什么顺序排的呢？是dimer、stability、还是默认的none呢？ 2011-11-23 09:29:35
是的。网址为：http://primerexplorer.jp/e/index.html。我用的时候只有V3，V4应该是后出来的，建议先用V3来设计，也可以看看使用说明，网站上有Guide可以下载。引物首选前三条进行具体分析，一般来说第一对引物是分值最高的。Guide里也有分值的评分说明。希望可以帮到你。回晚了，不好意思哈~
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4楼2011-11-23 08:29:50
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wangxiaoyu8

金虫 (小有名气)
太感谢了，请问您所说的前三对引物是按什么顺序排的呢？是dimer、stability、还是默认的none呢？
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5楼2011-11-23 09:31:10
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hzl5888

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

wangxiaoyu8(金币+2): 哦，这样啊，谢谢。我还以为是dimer排序靠前的越好呢，none排序的我也没有看到打分啊。 2011-11-25 08:49:50
引用回帖:
5楼: Originally posted by wangxiaoyu8 at 2011-11-23 09:31:10:
太感谢了，请问您所说的前三对引物是按什么顺序排的呢？是dimer、stability、还是默认的none呢？

不客气！我当时排序是按none的，然后就选了排位第一的引物去合成，然后就做出来了，一切欧了，啊哈哈~祝你实验顺利！~~
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6楼2011-11-24 11:36:37
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wangxiaoyu8

金虫 (小有名气)
哦，这样啊，谢谢。我还以为是dimer排序靠前的越好呢，none排序的我也没有看到打分啊。
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7楼2011-11-25 08:50:03
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功夫熊猫9527

新虫 (初入文坛)
我做不出来 是不是模版不够好
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8楼2012-05-25 19:55:50
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woshizhufeng

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引物很不好设计的，设计了几对了，都不太好使，请教各位
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9楼2012-08-04 10:41:21
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小gao8

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
86654楼: Originally posted by wangxiaoyu8 at 2011-11-19 09:49:15
请问在使用primerexplore设计LAMP引物时，在线软件V3和V4有什么区别呢，当设计出许多引物时，第一步怎么选择，是看dG（dimmer）值吗，怎么看，说明书里的“Primer sets are chosen that encompasses the entire len ...

这俩版本没什么大的区别
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10楼2012-08-04 21:54:31
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