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wangxiaoyu8

金虫 (小有名气)

[求助] LAMP(环介导等温扩增技术)已有1人参与

请问在使用primerexplore设计LAMP引物时,在线软件V3和V4有什么区别呢,当设计出许多引物时,第一步怎么选择,是看dG(dimmer)值吗,怎么看,说明书里的“Primer sets are chosen that encompasses the entire length if possible”是啥意思啊?请各位高手指教~
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hzl5888

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

wangxiaoyu8(金币+1): 谢谢支持~ 2011-11-22 12:38:31
我记得我当时做LAMP这个实验的时候,引物设计用的是在线的一个软件,很简单好用,但是网址家里的电脑没收藏,周一去单位找一下。楼主可以试用一下。
2楼2011-11-20 08:26:54
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普通回帖

wangxiaoyu8

金虫 (小有名气)

在线软件就是primerexplore吧?网址是http://primerexplorer.jp/e/,里面有两种,V3和V4,但二者区别我一直没搞懂,引物设计选择也没弄懂,恭候赐教~
3楼2011-11-20 09:05:29
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hzl5888

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

wangxiaoyu8(金币+3): 太感谢了,请问您所说的前三对引物是按什么顺序排的呢?是dimer、stability、还是默认的none呢? 2011-11-23 09:29:35
是的。网址为:http://primerexplorer.jp/e/index.html。我用的时候只有V3,V4应该是后出来的,建议先用V3来设计,也可以看看使用说明,网站上有Guide可以下载。引物首选前三条进行具体分析,一般来说第一对引物是分值最高的。Guide里也有分值的评分说明。希望可以帮到你。回晚了,不好意思哈~
4楼2011-11-23 08:29:50
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wangxiaoyu8

金虫 (小有名气)

太感谢了,请问您所说的前三对引物是按什么顺序排的呢?是dimer、stability、还是默认的none呢?
5楼2011-11-23 09:31:10
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hzl5888

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

wangxiaoyu8(金币+2): 哦,这样啊,谢谢。我还以为是dimer排序靠前的越好呢,none排序的我也没有看到打分啊。 2011-11-25 08:49:50
引用回帖:
5楼: Originally posted by wangxiaoyu8 at 2011-11-23 09:31:10:
太感谢了,请问您所说的前三对引物是按什么顺序排的呢?是dimer、stability、还是默认的none呢?

不客气!我当时排序是按none的,然后就选了排位第一的引物去合成,然后就做出来了,一切欧了,啊哈哈~祝你实验顺利!~~
6楼2011-11-24 11:36:37
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wangxiaoyu8

金虫 (小有名气)

哦,这样啊,谢谢。我还以为是dimer排序靠前的越好呢,none排序的我也没有看到打分啊。
7楼2011-11-25 08:50:03
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功夫熊猫9527

新虫 (初入文坛)

我做不出来 是不是模版不够好
8楼2012-05-25 19:55:50
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woshizhufeng

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引物很不好设计的,设计了几对了,都不太好使,请教各位
9楼2012-08-04 10:41:21
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小gao8

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
86654楼: Originally posted by wangxiaoyu8 at 2011-11-19 09:49:15
请问在使用primerexplore设计LAMP引物时,在线软件V3和V4有什么区别呢,当设计出许多引物时,第一步怎么选择,是看dG(dimmer)值吗,怎么看,说明书里的“Primer sets are chosen that encompasses the entire len ...

这俩版本没什么大的区别
10楼2012-08-04 21:54:31
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