24小时热门版块排行榜

返回列表

duanxiaome

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 2
帖子: 24
在线: 5.4小时
虫号: 1749695
注册: 2012-04-11
专业: 微生物生理与生物化学

[求助] 基因组组装注释问题已有1人参与

本人最近刚接触生物信息，想做一个小植物的基因组组装注释，请教各位下，有没有这方面的流程跟各个步骤使用的软件？或者一个完整的报告？是真核生物，二倍体。

回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

大家对微生物测过全基因组嘛？进来讨论一下吧~ 已经有11人回复
高通量测序序列分析已经有18人回复
5‘Race验证miRNA靶点的原理已经有40人回复
求转录组测序相关文章已经有14人回复
植物转录组测序结果已经有9人回复
公布的基因组没有这个基因的注释，而用其他软件发现了这个基因，如何？已经有4人回复
求助细菌基因组组装已经有18人回复
973项目首席科学家高校排名已经有10人回复
华大基因生物信息学--暑期培训班已经有4人回复
生物信息学专题－生物版，医学版和信息科学版共同创建已经有87人回复

1楼 2014-06-29 14:45:20

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

growlywolf

金虫 (小有名气)

应助: 39 (小学生)
金币: 3077
散金: 1111
红花: 10
帖子: 233
在线: 87.2小时
虫号: 2454017
注册: 2013-05-08
专业: 生物信息学

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

植物基因组组装？随便在nature、Science、Nature genetics、nature communication上面找一篇植物全基因组测序的论文读读methods就知道怎么玩了。

问题是，你有de novo测序的数据？包括pair-end和mate-pair等不同的测序文库？你有64G以上内存的服务器？

赞一下