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fengxue151金虫 (小有名气)
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[求助]
关于squeeze命令和溶剂分子个数问题
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本人有一个晶体数据,由于溶剂(乙酸乙酯)分子无序,因此是使用了Squeeze命令,但是不知道接下来怎么说明和计算溶剂分子数目,(我计算的是381/16/48=0.49,不知道对不对)求各位高手指教,相关数据如下: I4(1)cd空间群,check cif显示Z值为16, 然后还想问SQF文件中73 和24都是什么意思 SQF文件: # SQUEEZE RESULTS # Note: Data are Listed for all Voids in the P1 Unit Cell # i.e. Centre of Gravity, Solvent Accessible Volume, # Recovered number of Electrons in the Void and # Details about the Squeezed Material loop_ _platon_squeeze_void_nr _platon_squeeze_void_average_x _platon_squeeze_void_average_y _platon_squeeze_void_average_z _platon_squeeze_void_volume _platon_squeeze_void_count_electrons _platon_squeeze_void_content 1 0.046 0.107 0.445 73 24 ' ' 2 -0.047 0.107 0.945 73 24 ' ' 3 -0.047 0.893 0.445 73 24 ' ' 4 0.046 0.893 0.945 73 24 ' ' 5 0.107 0.454 0.694 73 24 ' ' 6 0.107 0.546 0.194 73 24 ' ' 7 0.392 -0.046 0.695 73 24 ' ' 8 0.392 1.046 0.195 73 24 ' ' 9 0.453 0.393 0.944 73 24 ' ' 10 0.453 0.607 0.445 73 24 ' ' 11 0.546 0.393 0.445 73 24 ' ' 12 0.546 0.607 0.945 73 24 ' ' 13 0.607 0.046 0.694 73 24 ' ' 14 0.607 0.954 0.194 73 24 ' ' 15 0.892 0.546 0.695 73 24 ' ' 16 0.892 0.454 0.195 73 24 ' ' _platon_squeeze_details ? SQZ文件: TITL BO2754 in I4(1)cd CELL 26.3332 26.3332 17.9578 90.00 90.00 90.00 SPGR I41cd # Solvent Accessible Volume = 1187.2 # Electrons Found in S.A.V. = 381.5 # Note: Atoms in Void as Cxxx and Qxxx all others C101 0.478 0.557 0.488 ! 6.57 eA-3 C102 0.452 0.368 0.483 ! 4.76 eA-3 C103 0.071 0.921-0.002 ! 1.80 eA-3 C104 0.361 0.604 0.423 ! 0.57 eA-3 C105 0.874 0.907 0.481 ! 0.55 eA-3 Q106 0.870 0.939 0.453 ! 0.54 eA-3 Q107 0.042 0.595 0.191 ! 0.51 eA-3 LIS文件部分数据: Summary and Remarks : N = NOTE, W = WARNING, E = ERROR ================================================================================ N: No S.U.'s (esd) on observed/calculated parameters. -------------------------------------------------------------------------------- N: Number of moved primary input atoms: .................................. 84 N: Number of Ignored Lines on INPUT ...................................... 5 of which blank in column 1 ..................................... 5 N: Total Potential Solvent Accessible Void Vol .................. 1187.2 Ang^3 N: Electron Count / Cell = 380 ================================================================================ |
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2楼2014-07-02 18:31:56
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