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飞鸿印雪jay银虫 (小有名气)
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[求助]
想用遗传算法求解动力学参数 已有2人参与
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dCAdt =-k(1)*C(1)-k(2)*C(1)-k(3)*C(1); dCBdt =k(1)*C(1)-k(4)*C(2)-k(5)*C(2); dCCdt =k(2)*C(1)+k(4)*C(2)-k(6)*C(3); dCDdt =k(3)*C(1)+k(5)*C(2)+k(6)*C(3); 请问怎么用遗传算法求解参数k啊，c的数值都是实验已知的，我用lsqnonlin求解，但是精度比较低。 |
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飞鸿印雪jay
银虫 (小有名气)
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fegg7502: 金币+1, 鼓励交流 2014-06-24 08:37:01
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format long clear all clc tspan = [0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120]; x0 = [0.877667262 0.188437508 0.069051676 0.067639913]; k0 = [0 0 0 0 0 0]; lb = [0 0 0 0 0 0]; ub = [+inf +inf +inf +inf +inf +inf]; data=[ 0.683038504 0.34538674 0.138009043 0.135964027 0.398422967 0.413279625 0.203080312 0.189874719 0.266300405 0.468253074 0.289896419 0.348481733 0.142059055 0.397710816 0.305786676 0.424846321 0.068339284 0.34043909 0.335003128 0.497043462 0.049669997 0.312376889 0.351124377 0.609259358 0.025110016 0.237590973 0.335397788 0.723901322 0.012801963 0.197342301 0.32083196 0.736810004 0.005763427 0.156055501 0.306141448 0.834373408 0.002640872 0.10259385 0.238964753 0.755687994 0.001332663 0.091170321 0.248694235 0.903738353 0.004102735 0.066072318 0.220813975 0.917511998 ]; yexp = data(:,1:4); [k,resnorm,residual,exitflag,output,lambda,jacobian] =... lsqnonlin(@ObjFunc,k0,lb,ub,[],tspan,x0,yexp); ci = nlparci(k,residual,jacobian); fprintf('\n\n使用函数lsqnonlin()估计得到的参数值为:\n') fprintf('\tk1 = %.9f ± %.9f\n',k(1),ci(1,2)-k(1)) fprintf('\tk2 = %.9f ± %.9f\n',k(2),ci(2,2)-k(2)) fprintf('\tk3 = %.9f ± %.9f\n',k(3),ci(3,2)-k(3)) fprintf('\tk4 = %.9f ± %.9f\n',k(4),ci(4,2)-k(4)) fprintf('\tk5 = %.9f ± %.9f\n',k(5),ci(5,2)-k(5)) fprintf('\tk6 = %.9f ± %.9f\n',k(6),ci(6,2)-k(6)) %fprintf('\tk7 = %.9f ± %.9f\n',k(7),ci(7,2)-k(7)) %fprintf('\tk8 = %.9f ± %.9f\n',k(8),ci(8,2)-k(8)) %fprintf('\tk9 = %.9f ± %.9f\n',k(9),ci(9,2)-k(9)) %fprintf('\tk10 = %.9f ± %.9f\n',k(10),ci(10,2)-k(10)) fprintf('The sum of the squares is: %.9e\n\n',resnorm) function f = ObjFunc(k,tspan,x0,yexp) [t, Xsim] = ode45(@KineticsEqs,tspan,x0,[],k); Xsim1=Xsim(:,1); Xsim2=Xsim(:,2); Xsim3=Xsim(:,3); Xsim4=Xsim(:,4); %Xsim5=Xsim(:,5); %Xsim6=Xsim(:,6); ysim(:,1) = Xsim1(2:end); ysim(:,2) = Xsim2(2:end); ysim(:,3) = Xsim3(2:end); ysim(:,4) = Xsim4(2:end); %ysim(:,5) = Xsim5(2:end); %ysim(:,6) = Xsim6(2:end); size(ysim(:,1)); size(ysim(:,2)); size(ysim(:,3)); size(ysim(:,4)); %size(ysim(:,5)); %size(ysim(:,6)); size(yexp(:,1)); size(yexp(:,2)); size(yexp(:,3)); size(yexp(:,4)); %size(yexp(:,5)); %size(yexp(:,6)); f = [(ysim(:,1)-yexp(:,1)) (ysim(:,2)-yexp(:,2)) (ysim(:,3)-yexp(:,3)) (ysim(:,4)-yexp(:,4)) ];%(ysim(:,5)-yexp(:,5)) function dCdt = KineticsEqs(t,C,k) dCAdt =-k(1)*C(1)-k(2)*C(1)-k(3)*C(1); dCBdt =k(1)*C(1)-k(4)*C(2)-k(5)*C(2); dCCdt =k(2)*C(1)+k(4)*C(2)-k(6)*C(3); dCDdt =k(3)*C(1)+k(5)*C(2)+k(6)*C(3); dCdt = [dCAdt; dCBdt;dCCdt;dCDdt]; |
4楼2014-06-23 00:09:40
dingd
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飞鸿印雪jay
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fegg7502: 金币+1, 鼓励交流 2014-06-24 08:37:08
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我目前是用这个程序算的，但是结果中的置信区间大于参数本身 k1 = 0.037030991 ± 0.006759768 k2 = 0.007075182 ± 0.009153909 k3 = 0.000041516 ± 0.009209723 k4 = 0.013350201 ± 0.013257063 k5 = 0.015151332 ± 0.013589322 k6 = 0.012992896 ± 0.009006184 The sum of the squares is: 5.640933494e-02 这样是不是不符合物理意义呢？这样得到的结果能用吗？ 所以才想用遗传算法，据说全局搜索，精度会高。 |
5楼2014-06-23 00:13:21
