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xhm3230

铜虫 (小有名气)

[求助] 蛋白质酶解液质谱图,不会分析,请各位老师同学帮帮忙,分析一下 已有1人参与

附件是一个总离子图,还有两个提取的质谱图,请大家帮忙分析一下,这是胰蛋白酶酶解酪蛋白的酶解液的质谱图,想得到多肽、二肽、寡肽的分子量以及结构信息,能从提取的质谱图中分析得出该组分肽(多肽、二肽、寡肽)的氨基酸组成序列和分子量么?怎么分析?能说说具体步骤么?

蛋白质酶解液质谱图,不会分析,请各位老师同学帮帮忙,分析一下
提取峰2.png


蛋白质酶解液质谱图,不会分析,请各位老师同学帮帮忙,分析一下-1
提取峰1.png


蛋白质酶解液质谱图,不会分析,请各位老师同学帮帮忙,分析一下-2
总离子峰.png
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abe901

木虫 (正式写手)

1.PMF-把你每个液相峰对应的质谱图弄出来,理论上为每个肽段的m/z信息,所有肽 的m/z信息即为肽指纹图谱 去跟数据库匹配,百度下mascot。
提醒下,看一级谱数据的时候注意多电荷峰,多半是peptide
2.如果想得知序列信息,LC-MS/MS,每个峰的母离子选出来做MS/MS,尽量选择双电荷的(尤其分子量上1000的时候),碰撞能量目测20eV上下足以!同样也可搜库。
提醒下,MS/MS spectra出现系列-CO,-NH3的峰的时候多半是peptide。
6楼2015-07-21 11:12:14
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xhm3230

铜虫 (小有名气)

自己顶一下了!求大神解答!!
相信自己!
2楼2014-06-11 23:33:42
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空的天

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我去看了下额,百度说酪蛋白直到现在没有完全确定的分子式,分子量大约为57000-375000。。
首先,你把它酶解得到肽段然后具体想去做什么呢?
然后,信号很不好额,不知道你具体是哪个型号的仪器,还是说做的有问题,你的单位是E4,E5,信号很低。。我实验室做蛋白一般是E8才能说明问题。。
3楼2014-06-14 15:23:20
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xhm3230

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 空的天 at 2014-06-14 15:23:20
我去看了下额,百度说酪蛋白直到现在没有完全确定的分子式,分子量大约为57000-375000。。
首先,你把它酶解得到肽段然后具体想去做什么呢?
然后,信号很不好额,不知道你具体是哪个型号的仪器,还是说做的有问题 ...

仪器是美国waters公司UPLC/ Xevo G2 Qtof,我想做的就是想得到酪蛋白酶解之后得到的肽段的分子量,氨基酸序列,但是我这仪器上没有数据库,能不能帮帮忙解解质谱图
相信自己!
4楼2014-06-17 15:46:16
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