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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 分析 » 质谱分析 » 蛋白质酶解液质谱图，不会分析，请各位老师同学帮帮忙，分析一下
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xhm3230

铜虫 (小有名气)

[求助] 蛋白质酶解液质谱图，不会分析，请各位老师同学帮帮忙，分析一下 已有1人参与

附件是一个总离子图，还有两个提取的质谱图，请大家帮忙分析一下，这是胰蛋白酶酶解酪蛋白的酶解液的质谱图，想得到多肽、二肽、寡肽的分子量以及结构信息，能从提取的质谱图中分析得出该组分肽（多肽、二肽、寡肽）的氨基酸组成序列和分子量么？怎么分析？能说说具体步骤么？

蛋白质酶解液质谱图，不会分析，请各位老师同学帮帮忙，分析一下
提取峰2.png


蛋白质酶解液质谱图，不会分析，请各位老师同学帮帮忙，分析一下-1
提取峰1.png


蛋白质酶解液质谱图，不会分析，请各位老师同学帮帮忙，分析一下-2
总离子峰.png
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相信自己！
1楼 2014-06-10 21:42:43
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abe901

木虫 (正式写手)
1.PMF-把你每个液相峰对应的质谱图弄出来，理论上为每个肽段的m/z信息，所有肽 的m/z信息即为肽指纹图谱 去跟数据库匹配，百度下mascot。
提醒下，看一级谱数据的时候注意多电荷峰，多半是peptide
2.如果想得知序列信息，LC-MS/MS，每个峰的母离子选出来做MS/MS，尽量选择双电荷的（尤其分子量上1000的时候），碰撞能量目测20eV上下足以！同样也可搜库。
提醒下，MS/MS spectra出现系列-CO，-NH3的峰的时候多半是peptide。
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6楼2015-07-21 11:12:14
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xhm3230

铜虫 (小有名气)
自己顶一下了！求大神解答！！
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相信自己！
2楼2014-06-11 23:33:42
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空的天

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我去看了下额，百度说酪蛋白直到现在没有完全确定的分子式，分子量大约为57000-375000。。
首先，你把它酶解得到肽段然后具体想去做什么呢？
然后，信号很不好额，不知道你具体是哪个型号的仪器，还是说做的有问题，你的单位是E4，E5，信号很低。。我实验室做蛋白一般是E8才能说明问题。。
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3楼2014-06-14 15:23:20
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xhm3230

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 空的天 at 2014-06-14 15:23:20
我去看了下额，百度说酪蛋白直到现在没有完全确定的分子式，分子量大约为57000-375000。。
首先，你把它酶解得到肽段然后具体想去做什么呢？
然后，信号很不好额，不知道你具体是哪个型号的仪器，还是说做的有问题 ...

仪器是美国waters公司UPLC/ Xevo G2 Qtof，我想做的就是想得到酪蛋白酶解之后得到的肽段的分子量，氨基酸序列，但是我这仪器上没有数据库，能不能帮帮忙解解质谱图
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相信自己！
4楼2014-06-17 15:46:16
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