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jianchen7882金虫 (小有名气)
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gromacs氢键分析工具，g_hbond输出结果解析？已有1人参与
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| 如题，请教各位大神，g_hbond分析工具输出的结果有三列，第一列是时间，后两列是氢键数量，这里分析的是受体和配体拉伸时的氢键数量，请问为啥是两列氢键数量啊？？ |
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11楼2018-12-28 15:03:17
水儿CoCo
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【答案】应助回帖
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| 得出的文件里最上面非数据那几行里有写明是什么，楼主注意打开来看看就知道了 |
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2楼2014-06-10 15:09:18
jianchen7882
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谢谢，输出参数如下，具体解释一下好吗，谢谢！！1 # This file was created Mon May 26 20:35:37 2014 # by the following command: # g_hbond -f traj.xtc -s pull.tpr -num num.xvg # # g_hbond is part of G R O M A C S: # # GROningen Mixture of Alchemy and Childrens' Stories # "@ title ""Hydrogen Bonds""" "@ xaxis label ""Time (ps)""" "@ yaxis label ""Number""" @TYPE xy "@ view 0.15, 0.15, 0.75, 0.85" @ legend on @ legend box on @ legend loctype view "@ legend 0.78, 0.8" @ legend length 2 "@ s0 legend ""Hydrogen bonds""" "@ s1 legend ""Pairs within 0.35 nm""" 0 1 3 1 1 3 2 2 1 3 4 3 4 3 1 5 2 5 6 3 1 7 3 2 8 3 1 9 3 1 |
3楼2014-06-10 20:35:47
水儿CoCo
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第一列是时间，第二列是氢键数目，第三列是pairs with 0.35 nm |
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4楼2014-06-10 21:19:02