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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 将植物的一套代谢途径做到细菌或者真菌里面，靠谱么
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m情深守护

新虫 (小有名气)

[交流] 将植物的一套代谢途径做到细菌或者真菌里面，靠谱么

想做一个课题，关于植物的代谢产物的。lz想把这种产物做到细菌或者真菌里面，植物的这个产物的代谢通路已知，但是较为复杂，所经历的步骤较多且产物较为复杂。查细菌或者真菌所拥有的与这个产物的共同代谢中间物较少，要在细菌或者真菌里面构建新的代谢通路的工程量巨大啊，好多个基因啊~~~~请问有大神么做过类似的么，求经验~求毕业。。。。。。
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1楼2014-06-03 16:06:26
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starseacow

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m情深守护: 金币+5 2014-06-03 21:37:43
很靠谱，这是合成生物学比较成功的运用之一，青蒿素目前已经可以在酵母中合成，其方案就是将部分青蒿素代谢通路导入酵母中获得重要前体青蒿酸。如果楼主是在基础比较好的平台比较成熟的实验室，目前时间也比较充裕，可以考虑做这方面工作。
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2楼2014-06-03 21:19:39
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starseacow

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m情深守护: 金币+3 2014-06-03 21:37:57
关于青蒿素工作，可以参考如下文章
V. Martin, D. Pitera, S. Withers, et al. Engineering a mevalonate pathway in Escherich coli for production of terpenoids. Nature Biotechnology, 2003, 21(7): 796-803.
J. Newman, J. Marshall, M. Chang, et al. High level production amorpha-4,11-diene in a two-phase partitioning bioreactor of me- tabolically engineered Escherichia coli. Journal of Biotechnol- ogy, 2006, 95(4): 684-691
D. Ro, I. Parad, M. Ouellet, et al. Production of the antimalarial drug precursor artemisinic acid in engineered yeast. Nature, 2006, 440(7086): 940-943
Westfall, P. J. et al. Production of amorphadiene in yeast, and its conversion to dihydroartemisinic acid, precursor to the antimalarial agent artemisinin. Proc. Natl Acad. Sci. USA 109, E111–E118 (2012)
还有2013年一篇
Nature 496, 528–532 (25 April 2013)
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3楼2014-06-03 21:24:07
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m情深守护

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by starseacow at 2014-06-03 21:24:07
关于青蒿素工作，可以参考如下文章
V. Martin, D. Pitera, S. Withers, et al. Engineering a mevalonate pathway in Escherich coli for production of terpenoids. Nature Biotechnology, 2003, 21(7): 796-803. ...

谢了啊。
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4楼2014-06-03 21:38:06
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m情深守护

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by starseacow at 2014-06-03 21:19:39
很靠谱，这是合成生物学比较成功的运用之一，青蒿素目前已经可以在酵母中合成，其方案就是将部分青蒿素代谢通路导入酵母中获得重要前体青蒿酸。如果楼主是在基础比较好的平台比较成熟的实验室，目前时间也比较充裕， ...

我要做的代谢产物比较复杂，目前查的的文献也没在微生物做的，一般做的都是机理，或者是效用。合成途径最少需要20来步，要这样我一个做下去的话不实际啊。研一都快结束了。。。时间估计也是问题。还有就是得考虑转化率问题啊，步骤太多了，目标产物肯定很难达到预期。哎~~纠结了。。
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5楼2014-06-03 21:42:30
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starseacow

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m情深守护: 金币+2 2014-06-03 21:58:01
引用回帖:
5楼: Originally posted by m情深守护 at 2014-06-03 21:42:30
我要做的代谢产物比较复杂，目前查的的文献也没在微生物做的，一般做的都是机理，或者是效用。合成途径最少需要20来步，要这样我一个做下去的话不实际啊。研一都快结束了。。。时间估计也是问题。还有就是得考虑转 ...

研究生不建议你从整体合成的角度考虑，不妨尝试做生物转化，譬如饲喂某种前体，通过导入一些基因使微生物表达特定酶，从而获得另一种重要中间产物。这样做从你的状态和时间上讲比较靠谱。
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6楼2014-06-03 21:46:36
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m情深守护

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by starseacow at 2014-06-03 21:46:36
研究生不建议你从整体合成的角度考虑，不妨尝试做生物转化，譬如饲喂某种前体，通过导入一些基因使微生物表达特定酶，从而获得另一种重要中间产物。这样做从你的状态和时间上讲比较靠谱。...

谢谢、只是我听得不太明白，能给推荐一些这些方面的文献么，拜谢！
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7楼2014-06-03 21:52:50
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血性红魔
8楼2014-06-03 22:02:49
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m情深守护

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 血性红魔 at 2014-06-03 22:02:49

师兄我也北化的。。。。
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9楼2014-06-03 22:17:33
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starseacow

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wizardfan: 金币+5, 应助指数+1, 谢谢帮助 2014-06-04 04:01:50
合适的文献我手头没有，基本想法就是你在工程菌中导入某种酶基因并进行表达，这种酶可以催化特定反应，将某种前体转化为新的产物，相当于你借助工程菌完成了一步代谢反应。这样的工作选对了题，研究生期间是可能完成的。
参考文章，也许你可以看看这个，不是很贴合我的建议，不过基本思路很相近
黑曲霉葡萄糖氧化酶基因的克隆及其在酵母中的高效表达
周亚凤 生物工程学报 2001,17:400-405

另外，楼主做研究生需要自己选题么？没有导师或者实验室前辈指导么？
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10楼2014-06-03 23:13:49
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